Protein–RNA interactions for Protein: P26022

PTX3, Pentraxin-related protein PTX3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTX3P26022 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTX3P26022 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTX3P26022 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTX3P26022 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTX3P26022 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTX3P26022 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
PTX3P26022 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTX3P26022 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTX3P26022 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTX3P26022 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
PTX3P26022 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTX3P26022 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTX3P26022 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PTX3P26022 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
PTX3P26022 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PTX3P26022 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
PTX3P26022 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PTX3P26022 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTX3P26022 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTX3P26022 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTX3P26022 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTX3P26022 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTX3P26022 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTX3P26022 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTX3P26022 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTX3P26022 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTX3P26022 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PTX3P26022 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTX3P26022 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PTX3P26022 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTX3P26022 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTX3P26022 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTX3P26022 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTX3P26022 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTX3P26022 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTX3P26022 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTX3P26022 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTX3P26022 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTX3P26022 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTX3P26022 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTX3P26022 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTX3P26022 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTX3P26022 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTX3P26022 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTX3P26022 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTX3P26022 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTX3P26022 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTX3P26022 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTX3P26022 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTX3P26022 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTX3P26022 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTX3P26022 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTX3P26022 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTX3P26022 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTX3P26022 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTX3P26022 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTX3P26022 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTX3P26022 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTX3P26022 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTX3P26022 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTX3P26022 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTX3P26022 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTX3P26022 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTX3P26022 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTX3P26022 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTX3P26022 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTX3P26022 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTX3P26022 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTX3P26022 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTX3P26022 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTX3P26022 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTX3P26022 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTX3P26022 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PTX3P26022 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PTX3P26022 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTX3P26022 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTX3P26022 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTX3P26022 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTX3P26022 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTX3P26022 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PTX3P26022 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTX3P26022 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTX3P26022 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTX3P26022 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTX3P26022 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTX3P26022 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTX3P26022 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTX3P26022 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTX3P26022 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTX3P26022 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTX3P26022 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTX3P26022 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTX3P26022 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTX3P26022 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTX3P26022 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTX3P26022 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTX3P26022 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTX3P26022 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTX3P26022 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTX3P26022 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms