Protein–RNA interactions for Protein: P23470

PTPRG, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase gamma, humanhuman

Predictions only

Length 1,445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRGP23470 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
PTPRGP23470 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PTPRGP23470 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PTPRGP23470 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PTPRGP23470 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PTPRGP23470 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PTPRGP23470 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PTPRGP23470 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PTPRGP23470 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PTPRGP23470 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PTPRGP23470 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PTPRGP23470 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PTPRGP23470 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
PTPRGP23470 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
PTPRGP23470 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PTPRGP23470 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
PTPRGP23470 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
PTPRGP23470 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PTPRGP23470 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PTPRGP23470 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PTPRGP23470 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PTPRGP23470 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PTPRGP23470 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PTPRGP23470 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PTPRGP23470 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PTPRGP23470 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PTPRGP23470 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PTPRGP23470 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PTPRGP23470 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PTPRGP23470 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PTPRGP23470 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PTPRGP23470 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PTPRGP23470 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PTPRGP23470 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
PTPRGP23470 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
PTPRGP23470 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
PTPRGP23470 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PTPRGP23470 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PTPRGP23470 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PTPRGP23470 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PTPRGP23470 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PTPRGP23470 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PTPRGP23470 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PTPRGP23470 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PTPRGP23470 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PTPRGP23470 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PTPRGP23470 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PTPRGP23470 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PTPRGP23470 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
PTPRGP23470 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PTPRGP23470 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PTPRGP23470 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PTPRGP23470 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PTPRGP23470 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PTPRGP23470 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PTPRGP23470 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PTPRGP23470 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PTPRGP23470 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PTPRGP23470 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PTPRGP23470 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
PTPRGP23470 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PTPRGP23470 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PTPRGP23470 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PTPRGP23470 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PTPRGP23470 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
PTPRGP23470 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PTPRGP23470 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PTPRGP23470 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PTPRGP23470 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PTPRGP23470 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PTPRGP23470 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PTPRGP23470 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PTPRGP23470 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PTPRGP23470 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
PTPRGP23470 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
PTPRGP23470 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
PTPRGP23470 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
PTPRGP23470 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PTPRGP23470 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PTPRGP23470 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PTPRGP23470 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PTPRGP23470 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PTPRGP23470 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
PTPRGP23470 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PTPRGP23470 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PTPRGP23470 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PTPRGP23470 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PTPRGP23470 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PTPRGP23470 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PTPRGP23470 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
PTPRGP23470 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
PTPRGP23470 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
PTPRGP23470 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
PTPRGP23470 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
PTPRGP23470 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PTPRGP23470 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PTPRGP23470 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PTPRGP23470 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PTPRGP23470 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PTPRGP23470 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms