Protein–RNA interactions for Protein: P23327

HRC, Sarcoplasmic reticulum histidine-rich calcium-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HRCP23327 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
HRCP23327 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
HRCP23327 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
HRCP23327 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
HRCP23327 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
HRCP23327 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
HRCP23327 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
HRCP23327 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
HRCP23327 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
HRCP23327 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
HRCP23327 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
HRCP23327 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
HRCP23327 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
HRCP23327 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
HRCP23327 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
HRCP23327 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
HRCP23327 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
HRCP23327 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
HRCP23327 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
HRCP23327 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
HRCP23327 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
HRCP23327 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
HRCP23327 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
HRCP23327 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
HRCP23327 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
HRCP23327 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
HRCP23327 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
HRCP23327 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
HRCP23327 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
HRCP23327 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
HRCP23327 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
HRCP23327 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC26.86■■□□□ 1.89
HRCP23327 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
HRCP23327 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
HRCP23327 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
HRCP23327 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
HRCP23327 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
HRCP23327 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
HRCP23327 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
HRCP23327 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
HRCP23327 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
HRCP23327 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
HRCP23327 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
HRCP23327 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
HRCP23327 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
HRCP23327 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
HRCP23327 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
HRCP23327 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
HRCP23327 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
HRCP23327 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
HRCP23327 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
HRCP23327 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
HRCP23327 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
HRCP23327 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
HRCP23327 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
HRCP23327 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
HRCP23327 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
HRCP23327 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
HRCP23327 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
HRCP23327 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
HRCP23327 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
HRCP23327 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
HRCP23327 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
HRCP23327 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
HRCP23327 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
HRCP23327 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
HRCP23327 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
HRCP23327 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
HRCP23327 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
HRCP23327 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
HRCP23327 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
HRCP23327 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
HRCP23327 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
HRCP23327 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
HRCP23327 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
HRCP23327 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
HRCP23327 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
HRCP23327 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
HRCP23327 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
HRCP23327 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
HRCP23327 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
HRCP23327 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
HRCP23327 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
HRCP23327 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
HRCP23327 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
HRCP23327 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
HRCP23327 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
HRCP23327 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
HRCP23327 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
HRCP23327 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
HRCP23327 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
HRCP23327 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
HRCP23327 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
HRCP23327 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
HRCP23327 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
HRCP23327 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
HRCP23327 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
HRCP23327 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
HRCP23327 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
HRCP23327 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms