Protein–RNA interactions for Protein: P22676

CALB2, Calretinin, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALB2P22676 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CALB2P22676 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CALB2P22676 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CALB2P22676 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CALB2P22676 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CALB2P22676 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CALB2P22676 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CALB2P22676 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CALB2P22676 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CALB2P22676 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CALB2P22676 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CALB2P22676 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CALB2P22676 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
CALB2P22676 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CALB2P22676 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CALB2P22676 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CALB2P22676 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CALB2P22676 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CALB2P22676 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CALB2P22676 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CALB2P22676 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CALB2P22676 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CALB2P22676 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CALB2P22676 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CALB2P22676 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CALB2P22676 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CALB2P22676 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CALB2P22676 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CALB2P22676 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CALB2P22676 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CALB2P22676 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CALB2P22676 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CALB2P22676 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CALB2P22676 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CALB2P22676 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CALB2P22676 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CALB2P22676 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CALB2P22676 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CALB2P22676 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CALB2P22676 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CALB2P22676 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CALB2P22676 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CALB2P22676 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CALB2P22676 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CALB2P22676 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CALB2P22676 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CALB2P22676 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CALB2P22676 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CALB2P22676 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CALB2P22676 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CALB2P22676 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CALB2P22676 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CALB2P22676 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
CALB2P22676 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CALB2P22676 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CALB2P22676 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CALB2P22676 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CALB2P22676 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CALB2P22676 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CALB2P22676 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CALB2P22676 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CALB2P22676 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CALB2P22676 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CALB2P22676 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CALB2P22676 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CALB2P22676 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CALB2P22676 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CALB2P22676 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CALB2P22676 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CALB2P22676 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CALB2P22676 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CALB2P22676 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CALB2P22676 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CALB2P22676 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CALB2P22676 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CALB2P22676 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CALB2P22676 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CALB2P22676 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CALB2P22676 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CALB2P22676 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CALB2P22676 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CALB2P22676 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CALB2P22676 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CALB2P22676 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CALB2P22676 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CALB2P22676 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CALB2P22676 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CALB2P22676 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CALB2P22676 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CALB2P22676 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CALB2P22676 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CALB2P22676 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CALB2P22676 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CALB2P22676 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CALB2P22676 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CALB2P22676 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CALB2P22676 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CALB2P22676 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CALB2P22676 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CALB2P22676 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms