Protein–RNA interactions for Protein: P12644

BMP4, Bone morphogenetic protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BMP4P12644 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BMP4P12644 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BMP4P12644 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BMP4P12644 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BMP4P12644 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BMP4P12644 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BMP4P12644 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BMP4P12644 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BMP4P12644 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
BMP4P12644 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BMP4P12644 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
BMP4P12644 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
BMP4P12644 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BMP4P12644 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BMP4P12644 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BMP4P12644 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BMP4P12644 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BMP4P12644 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
BMP4P12644 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
BMP4P12644 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
BMP4P12644 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
BMP4P12644 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
BMP4P12644 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BMP4P12644 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
BMP4P12644 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BMP4P12644 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BMP4P12644 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BMP4P12644 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
BMP4P12644 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
BMP4P12644 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
BMP4P12644 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
BMP4P12644 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
BMP4P12644 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
BMP4P12644 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
BMP4P12644 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BMP4P12644 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
BMP4P12644 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
BMP4P12644 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BMP4P12644 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
BMP4P12644 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BMP4P12644 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BMP4P12644 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
BMP4P12644 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BMP4P12644 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
BMP4P12644 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
BMP4P12644 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
BMP4P12644 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BMP4P12644 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BMP4P12644 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
BMP4P12644 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BMP4P12644 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BMP4P12644 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
BMP4P12644 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
BMP4P12644 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.14
BMP4P12644 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BMP4P12644 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BMP4P12644 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BMP4P12644 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
BMP4P12644 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BMP4P12644 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
BMP4P12644 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BMP4P12644 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
BMP4P12644 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BMP4P12644 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
BMP4P12644 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BMP4P12644 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BMP4P12644 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
BMP4P12644 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
BMP4P12644 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BMP4P12644 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
BMP4P12644 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
BMP4P12644 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
BMP4P12644 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
BMP4P12644 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
BMP4P12644 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
BMP4P12644 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BMP4P12644 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BMP4P12644 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
BMP4P12644 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BMP4P12644 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BMP4P12644 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BMP4P12644 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
BMP4P12644 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
BMP4P12644 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
BMP4P12644 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BMP4P12644 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
BMP4P12644 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
BMP4P12644 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BMP4P12644 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
BMP4P12644 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BMP4P12644 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BMP4P12644 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BMP4P12644 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
BMP4P12644 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
BMP4P12644 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BMP4P12644 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BMP4P12644 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
BMP4P12644 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BMP4P12644 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BMP4P12644 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms