Protein–RNA interactions for Protein: O75648

TRMU, Mitochondrial tRNA-specific 2-thiouridylase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 421 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRMUO75648 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRMUO75648 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRMUO75648 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRMUO75648 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRMUO75648 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
TRMUO75648 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRMUO75648 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRMUO75648 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRMUO75648 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRMUO75648 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRMUO75648 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRMUO75648 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRMUO75648 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRMUO75648 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRMUO75648 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRMUO75648 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRMUO75648 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
TRMUO75648 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRMUO75648 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRMUO75648 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRMUO75648 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRMUO75648 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRMUO75648 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRMUO75648 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRMUO75648 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
TRMUO75648 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
TRMUO75648 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRMUO75648 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRMUO75648 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TRMUO75648 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TRMUO75648 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TRMUO75648 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
TRMUO75648 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TRMUO75648 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
TRMUO75648 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TRMUO75648 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
TRMUO75648 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TRMUO75648 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TRMUO75648 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
TRMUO75648 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TRMUO75648 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TRMUO75648 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
TRMUO75648 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TRMUO75648 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRMUO75648 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRMUO75648 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRMUO75648 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRMUO75648 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRMUO75648 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRMUO75648 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRMUO75648 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRMUO75648 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRMUO75648 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRMUO75648 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRMUO75648 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRMUO75648 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRMUO75648 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRMUO75648 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRMUO75648 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRMUO75648 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRMUO75648 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRMUO75648 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRMUO75648 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRMUO75648 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
TRMUO75648 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRMUO75648 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRMUO75648 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRMUO75648 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRMUO75648 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRMUO75648 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRMUO75648 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
TRMUO75648 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
TRMUO75648 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
TRMUO75648 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
TRMUO75648 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRMUO75648 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRMUO75648 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRMUO75648 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRMUO75648 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRMUO75648 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRMUO75648 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRMUO75648 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRMUO75648 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRMUO75648 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRMUO75648 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRMUO75648 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRMUO75648 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRMUO75648 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRMUO75648 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRMUO75648 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRMUO75648 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRMUO75648 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRMUO75648 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRMUO75648 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRMUO75648 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRMUO75648 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRMUO75648 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRMUO75648 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRMUO75648 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRMUO75648 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.8 ms