Protein–RNA interactions for Protein: O75533

SF3B1, Splicing factor 3B subunit 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 1,304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B1O75533 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.641e-6■■■■■ 114.1
SF3B1O75533 ADGRV1-202ENST00000425867 8141 ntTSL 57.31□□□□□ -1.243e-6■■■■■ 114.1
SF3B1O75533 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.244e-6■■■■■ 114
SF3B1O75533 ANXA11-202ENST00000372231 6720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.54e-6■■■■■ 114
SF3B1O75533 ANXA11-205ENST00000438331 6965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.54e-6■■■■■ 114
SF3B1O75533 SSBP3-207ENST00000426150 851 ntTSL 35.27□□□□□ -1.572e-6■■■■■ 114
SF3B1O75533 DENND5A-211ENST00000530780 611 ntTSL 321.79■■□□□ 1.084e-7■■■■■ 113.9
SF3B1O75533 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.592e-7■■■■■ 113.9
SF3B1O75533 KNOP1-204ENST00000567367 595 ntAPPRIS ALT2 TSL 313.59□□□□□ -0.232e-7■■■■■ 113.9
SF3B1O75533 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.131e-6■■■■■ 113.9
SF3B1O75533 ASB3-201ENST00000263634 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.071e-6■■■■■ 113.9
SF3B1O75533 ASB3-204ENST00000406687 2205 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.141e-6■■■■■ 113.9
SF3B1O75533 ASB3-211ENST00000482829 1910 ntTSL 512.8□□□□□ -0.361e-6■■■■■ 113.9
SF3B1O75533 ASB3-203ENST00000406053 2648 ntTSL 55.42□□□□□ -1.541e-6■■■■■ 113.9
SF3B1O75533 ATXN7-205ENST00000474513 728 ntTSL 1 (best)28.32■■■□□ 2.126e-6■■■■■ 113.8
SF3B1O75533 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.944e-6■■■■■ 113.8
SF3B1O75533 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.214e-6■■■■■ 113.8
SF3B1O75533 FGFRL1-206ENST00000512174 571 ntTSL 322.4■■□□□ 1.184e-6■■■■■ 113.8
SF3B1O75533 FGFRL1-204ENST00000507339 562 ntTSL 420.81■□□□□ 0.924e-6■■■■■ 113.8
SF3B1O75533 RNF103-CHMP3-201ENST00000440757 805 ntTSL 320.65■□□□□ 0.94e-6■■■■■ 113.8
SF3B1O75533 PIH1D1-221ENST00000601807 998 ntTSL 519.27■□□□□ 0.683e-10■■■■■ 113.8
SF3B1O75533 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.613e-10■■■■■ 113.8
SF3B1O75533 PIH1D1-212ENST00000596916 793 ntTSL 517.4■□□□□ 0.383e-10■■■■■ 113.8
SF3B1O75533 PIH1D1-220ENST00000601053 634 ntTSL 517.4■□□□□ 0.383e-10■■■■■ 113.8
SF3B1O75533 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.33e-10■■■■■ 113.8
SF3B1O75533 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.14e-6■■■■■ 113.8
SF3B1O75533 RNF103-CHMP3-202ENST00000604011 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.064e-6■■■■■ 113.8
SF3B1O75533 FGFRL1-201ENST00000264748 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.14e-6■■■■■ 113.8
SF3B1O75533 FGFRL1-202ENST00000398484 3639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.294e-6■■■■■ 113.8
SF3B1O75533 ATXN7L1-202ENST00000419735 5417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.884e-6■■■■■ 113.8
SF3B1O75533 ELF4-204ENST00000615377 3878 ntTSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.964e-6■■■■■ 113.8
SF3B1O75533 SPIRE1-204ENST00000440472 2109 ntTSL 1 (best)8.56□□□□□ -1.044e-6■■■■■ 113.8
SF3B1O75533 PTPRJ-203ENST00000526550 571 ntTSL 48.12□□□□□ -1.116e-6■■■■■ 113.8
SF3B1O75533 SPIRE1-207ENST00000462226 536 ntTSL 47.83□□□□□ -1.164e-6■■■■■ 113.8
SF3B1O75533 SPIRE1-206ENST00000453447 2107 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.224e-6■■■■■ 113.8
SF3B1O75533 SPIRE1-210ENST00000497844 546 ntTSL 55.84□□□□□ -1.474e-6■■■■■ 113.8
SF3B1O75533 SPIRE1-205ENST00000449797 701 ntTSL 35.47□□□□□ -1.534e-6■■■■■ 113.8
SF3B1O75533 RFESD-206ENST00000508206 725 ntTSL 33.69□□□□□ -1.824e-6■■■■■ 113.8
SF3B1O75533 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.292e-6■■■■■ 113.8
SF3B1O75533 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.142e-6■■■■■ 113.8
SF3B1O75533 MAP2K7-203ENST00000397983 3396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.062e-6■■■■■ 113.8
SF3B1O75533 CLASP2-213ENST00000480013 5972 ntTSL 5 BASIC8.45□□□□□ -1.064e-7■■■■■ 113.8
SF3B1O75533 CLASP2-205ENST00000461133 4814 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.384e-7■■■■■ 113.8
SF3B1O75533 GART-208ENST00000430874 1036 ntTSL 523.19■■□□□ 1.31e-7■■■■■ 113.7
SF3B1O75533 FOXK2-204ENST00000527313 779 ntTSL 322.27■■□□□ 1.164e-8■■■■■ 113.7
SF3B1O75533 FOXK2-207ENST00000570585 756 ntTSL 315.21■□□□□ 0.034e-8■■■■■ 113.7
SF3B1O75533 GART-214ENST00000476524 806 ntTSL 29.86□□□□□ -0.831e-7■■■■■ 113.7
SF3B1O75533 GART-202ENST00000366093 805 ntTSL 38.71□□□□□ -1.021e-7■■■■■ 113.7
SF3B1O75533 GART-207ENST00000426819 837 ntTSL 58.61□□□□□ -1.031e-7■■■■■ 113.7
SF3B1O75533 GART-218ENST00000497313 457 ntTSL 38.37□□□□□ -1.071e-7■■■■■ 113.7
SF3B1O75533 GART-217ENST00000488791 778 ntTSL 37.49□□□□□ -1.211e-7■■■■■ 113.7
SF3B1O75533 EHMT1-201ENST00000371394 2679 ntTSL 214.52□□□□□ -0.093e-6■■■■■ 113.7
SF3B1O75533 YIPF3-204ENST00000455768 843 ntTSL 522.38■■□□□ 1.172e-6■■■■■ 113.6
SF3B1O75533 YIPF3-205ENST00000460547 1674 ntTSL 1 (best)17.51■□□□□ 0.392e-6■■■■■ 113.6
SF3B1O75533 YIPF3-206ENST00000460903 605 ntTSL 216.96■□□□□ 0.32e-6■■■■■ 113.6
SF3B1O75533 YIPF3-212ENST00000503972 933 ntTSL 516.51■□□□□ 0.232e-6■■■■■ 113.6
SF3B1O75533 YIPF3-203ENST00000416380 1005 ntTSL 513.73□□□□□ -0.212e-6■■■■■ 113.6
SF3B1O75533 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.664e-6■■■■■ 113.6
SF3B1O75533 GPHN-211ENST00000556020 562 ntTSL 418.89■□□□□ 0.616e-6■■■■■ 113.6
SF3B1O75533 CCDC88C-209ENST00000554872 1165 ntTSL 417.6■□□□□ 0.414e-6■■■■■ 113.6
SF3B1O75533 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.384e-6■■■■■ 113.6
SF3B1O75533 HCLS1-203ENST00000464274 552 ntTSL 416.62■□□□□ 0.254e-6■■■■■ 113.6
SF3B1O75533 HCLS1-211ENST00000495491 1219 ntTSL 214.17□□□□□ -0.144e-6■■■■■ 113.6
SF3B1O75533 TBC1D15-214ENST00000546932 557 ntTSL 413.93□□□□□ -0.186e-7■■■■■ 113.6
SF3B1O75533 TLR5-202ENST00000407096 459 ntTSL 313.86□□□□□ -0.194e-6■■■■■ 113.6
SF3B1O75533 PRPF6-201ENST00000266079 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.336e-7■■■■■ 113.6
SF3B1O75533 TBC1D15-212ENST00000498482 566 ntTSL 412.58□□□□□ -0.46e-7■■■■■ 113.6
SF3B1O75533 TLR5-201ENST00000366881 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.464e-6■■■■■ 113.6
SF3B1O75533 CCDC88C-206ENST00000553437 550 ntTSL 211.23□□□□□ -0.614e-6■■■■■ 113.6
SF3B1O75533 TLR5-205ENST00000540964 4088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.424e-6■■■■■ 113.6
SF3B1O75533 RC3H1-201ENST00000258349 10988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.612e-6■■■■■ 113.6
SF3B1O75533 SEC14L1-224ENST00000589827 1791 ntTSL 212.77□□□□□ -0.366e-6■■■■■ 113.5
SF3B1O75533 KIAA1958-201ENST00000337530 11775 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.934e-6■■■■■ 113.5
SF3B1O75533 KIAA1958-203ENST00000536272 7650 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.24e-6■■■■■ 113.5
SF3B1O75533 SPAG9-215ENST00000513746 822 ntTSL 518.22■□□□□ 0.511e-6■■■■■ 113.5
SF3B1O75533 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.562e-6■■■■■ 113.5
SF3B1O75533 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.792e-6■■■■■ 113.5
SF3B1O75533 CAPZB-201ENST00000264202 858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.062e-6■■■■■ 113.5
SF3B1O75533 DHX57-211ENST00000622155 5519 ntTSL 1 (best)8.59□□□□□ -1.034e-6■■■■■ 113.4
SF3B1O75533 DHX57-203ENST00000457308 4859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.154e-6■■■■■ 113.4
SF3B1O75533 DHX57-210ENST00000620517 4109 ntTSL 1 (best)5.47□□□□□ -1.534e-6■■■■■ 113.4
SF3B1O75533 CDC42-204ENST00000411827 597 ntTSL 320.01■□□□□ 0.791e-7■■■■■ 113.4
SF3B1O75533 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.212e-6■■■■■ 113.4
SF3B1O75533 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.21e-7■■■■■ 113.4
SF3B1O75533 CDC42-202ENST00000344548 2256 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.161e-7■■■■■ 113.4
SF3B1O75533 CDC42-201ENST00000315554 1452 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.051e-7■■■■■ 113.4
SF3B1O75533 CDC42-205ENST00000498236 816 ntTSL 58.01□□□□□ -1.131e-7■■■■■ 113.4
SF3B1O75533 SMOC2-201ENST00000354536 3150 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.053e-6■■■■■ 113.4
SF3B1O75533 SMOC2-202ENST00000356284 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.143e-6■■■■■ 113.4
SF3B1O75533 JMJD1C-210ENST00000542921 8149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.882e-7■■■■■ 113.3
SF3B1O75533 JMJD1C-203ENST00000402544 8011 ntTSL 1 (best)2.39□□□□□ -2.032e-7■■■■■ 113.3
SF3B1O75533 FGGY-207ENST00000430447 2485 ntTSL 212.25□□□□□ -0.453e-6■■■■■ 113.3
SF3B1O75533 USP6NL-202ENST00000379237 4546 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.611e-6■■■■■ 113.2
SF3B1O75533 SLC35C2-213ENST00000543605 5740 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.033e-6■■■■■ 113.2
SF3B1O75533 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.36e-6■■■■■ 113.1
SF3B1O75533 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.426e-6■■■■■ 113.1
SF3B1O75533 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.256e-6■■■■■ 113.1
SF3B1O75533 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.197e-6■■■■■ 113.1
SF3B1O75533 IFNGR2-206ENST00000545369 966 ntTSL 520.3■□□□□ 0.846e-6■■■■■ 113.1
SF3B1O75533 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.177e-6■■■■■ 113.1
Retrieved 100 of 46,956 protein–RNA pairs in 1324.1 ms