Protein–RNA interactions for Protein: O60662

KLHL41, Kelch-like protein 41, humanhuman

Predictions only

Length 606 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL41O60662 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL41O60662 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL41O60662 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL41O60662 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL41O60662 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL41O60662 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL41O60662 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL41O60662 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL41O60662 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL41O60662 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL41O60662 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL41O60662 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL41O60662 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL41O60662 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL41O60662 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL41O60662 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL41O60662 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL41O60662 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL41O60662 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL41O60662 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL41O60662 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL41O60662 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL41O60662 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL41O60662 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL41O60662 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL41O60662 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL41O60662 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL41O60662 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL41O60662 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL41O60662 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KLHL41O60662 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KLHL41O60662 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KLHL41O60662 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KLHL41O60662 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KLHL41O60662 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KLHL41O60662 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KLHL41O60662 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KLHL41O60662 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KLHL41O60662 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KLHL41O60662 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KLHL41O60662 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KLHL41O60662 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KLHL41O60662 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KLHL41O60662 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KLHL41O60662 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KLHL41O60662 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KLHL41O60662 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KLHL41O60662 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KLHL41O60662 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KLHL41O60662 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KLHL41O60662 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KLHL41O60662 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KLHL41O60662 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KLHL41O60662 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KLHL41O60662 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KLHL41O60662 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KLHL41O60662 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KLHL41O60662 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KLHL41O60662 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KLHL41O60662 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KLHL41O60662 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KLHL41O60662 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KLHL41O60662 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
KLHL41O60662 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
KLHL41O60662 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KLHL41O60662 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KLHL41O60662 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KLHL41O60662 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KLHL41O60662 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KLHL41O60662 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHL41O60662 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHL41O60662 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHL41O60662 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHL41O60662 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHL41O60662 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHL41O60662 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHL41O60662 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHL41O60662 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHL41O60662 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHL41O60662 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHL41O60662 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHL41O60662 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHL41O60662 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHL41O60662 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHL41O60662 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHL41O60662 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHL41O60662 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHL41O60662 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHL41O60662 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHL41O60662 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHL41O60662 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHL41O60662 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHL41O60662 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHL41O60662 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHL41O60662 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHL41O60662 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHL41O60662 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHL41O60662 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHL41O60662 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHL41O60662 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.8 ms