Protein–RNA interactions for Protein: O43524

FOXO3, Forkhead box protein O3, humanhuman

Predictions only

Length 673 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXO3O43524 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
FOXO3O43524 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
FOXO3O43524 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
FOXO3O43524 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FOXO3O43524 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
FOXO3O43524 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
FOXO3O43524 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
FOXO3O43524 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
FOXO3O43524 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FOXO3O43524 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
FOXO3O43524 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
FOXO3O43524 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
FOXO3O43524 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
FOXO3O43524 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
FOXO3O43524 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FOXO3O43524 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
FOXO3O43524 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
FOXO3O43524 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
FOXO3O43524 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
FOXO3O43524 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
FOXO3O43524 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
FOXO3O43524 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
FOXO3O43524 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
FOXO3O43524 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
FOXO3O43524 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
FOXO3O43524 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
FOXO3O43524 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
FOXO3O43524 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
FOXO3O43524 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
FOXO3O43524 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
FOXO3O43524 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
FOXO3O43524 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
FOXO3O43524 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
FOXO3O43524 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
FOXO3O43524 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
FOXO3O43524 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
FOXO3O43524 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
FOXO3O43524 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
FOXO3O43524 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
FOXO3O43524 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
FOXO3O43524 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
FOXO3O43524 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
FOXO3O43524 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
FOXO3O43524 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
FOXO3O43524 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.32
FOXO3O43524 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
FOXO3O43524 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
FOXO3O43524 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
FOXO3O43524 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FOXO3O43524 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
FOXO3O43524 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FOXO3O43524 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
FOXO3O43524 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FOXO3O43524 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FOXO3O43524 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
FOXO3O43524 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
FOXO3O43524 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
FOXO3O43524 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FOXO3O43524 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FOXO3O43524 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
FOXO3O43524 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
FOXO3O43524 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
FOXO3O43524 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
FOXO3O43524 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
FOXO3O43524 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
FOXO3O43524 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
FOXO3O43524 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
FOXO3O43524 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FOXO3O43524 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FOXO3O43524 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FOXO3O43524 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FOXO3O43524 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FOXO3O43524 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FOXO3O43524 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FOXO3O43524 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FOXO3O43524 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FOXO3O43524 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FOXO3O43524 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FOXO3O43524 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FOXO3O43524 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FOXO3O43524 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FOXO3O43524 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FOXO3O43524 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FOXO3O43524 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FOXO3O43524 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FOXO3O43524 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FOXO3O43524 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FOXO3O43524 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FOXO3O43524 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FOXO3O43524 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FOXO3O43524 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FOXO3O43524 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FOXO3O43524 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FOXO3O43524 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FOXO3O43524 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FOXO3O43524 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FOXO3O43524 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FOXO3O43524 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FOXO3O43524 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FOXO3O43524 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.6 ms