Protein–RNA interactions for Protein: O43490

PROM1, Prominin-1, humanhuman

Predictions only

Length 865 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PROM1O43490 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PROM1O43490 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PROM1O43490 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PROM1O43490 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PROM1O43490 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PROM1O43490 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PROM1O43490 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PROM1O43490 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PROM1O43490 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PROM1O43490 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PROM1O43490 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PROM1O43490 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PROM1O43490 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PROM1O43490 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PROM1O43490 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PROM1O43490 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PROM1O43490 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PROM1O43490 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PROM1O43490 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PROM1O43490 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PROM1O43490 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PROM1O43490 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PROM1O43490 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PROM1O43490 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PROM1O43490 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PROM1O43490 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PROM1O43490 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PROM1O43490 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PROM1O43490 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PROM1O43490 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PROM1O43490 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PROM1O43490 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PROM1O43490 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PROM1O43490 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PROM1O43490 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PROM1O43490 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PROM1O43490 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PROM1O43490 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PROM1O43490 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PROM1O43490 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PROM1O43490 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PROM1O43490 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PROM1O43490 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PROM1O43490 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PROM1O43490 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PROM1O43490 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PROM1O43490 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PROM1O43490 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PROM1O43490 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PROM1O43490 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PROM1O43490 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PROM1O43490 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PROM1O43490 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PROM1O43490 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PROM1O43490 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PROM1O43490 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PROM1O43490 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PROM1O43490 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PROM1O43490 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PROM1O43490 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PROM1O43490 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PROM1O43490 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PROM1O43490 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PROM1O43490 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PROM1O43490 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PROM1O43490 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PROM1O43490 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PROM1O43490 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PROM1O43490 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PROM1O43490 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PROM1O43490 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PROM1O43490 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PROM1O43490 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PROM1O43490 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PROM1O43490 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PROM1O43490 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PROM1O43490 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PROM1O43490 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
PROM1O43490 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PROM1O43490 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
PROM1O43490 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PROM1O43490 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PROM1O43490 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PROM1O43490 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PROM1O43490 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PROM1O43490 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PROM1O43490 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PROM1O43490 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PROM1O43490 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PROM1O43490 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PROM1O43490 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PROM1O43490 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PROM1O43490 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PROM1O43490 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PROM1O43490 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PROM1O43490 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PROM1O43490 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PROM1O43490 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PROM1O43490 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PROM1O43490 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms