Protein–RNA interactions for Protein: B2RUZ4

SMIM1, Small integral membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 78 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM1B2RUZ4 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
SMIM1B2RUZ4 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
SMIM1B2RUZ4 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
SMIM1B2RUZ4 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
SMIM1B2RUZ4 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
SMIM1B2RUZ4 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
SMIM1B2RUZ4 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
SMIM1B2RUZ4 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
SMIM1B2RUZ4 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
SMIM1B2RUZ4 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
SMIM1B2RUZ4 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
SMIM1B2RUZ4 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
SMIM1B2RUZ4 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
SMIM1B2RUZ4 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
SMIM1B2RUZ4 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
SMIM1B2RUZ4 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
SMIM1B2RUZ4 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
SMIM1B2RUZ4 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
SMIM1B2RUZ4 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
SMIM1B2RUZ4 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
SMIM1B2RUZ4 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
SMIM1B2RUZ4 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
SMIM1B2RUZ4 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
SMIM1B2RUZ4 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
SMIM1B2RUZ4 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
SMIM1B2RUZ4 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
SMIM1B2RUZ4 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
SMIM1B2RUZ4 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
SMIM1B2RUZ4 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
SMIM1B2RUZ4 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
SMIM1B2RUZ4 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
SMIM1B2RUZ4 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
SMIM1B2RUZ4 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
SMIM1B2RUZ4 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
SMIM1B2RUZ4 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
SMIM1B2RUZ4 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
SMIM1B2RUZ4 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
SMIM1B2RUZ4 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
SMIM1B2RUZ4 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
SMIM1B2RUZ4 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
SMIM1B2RUZ4 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
SMIM1B2RUZ4 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
SMIM1B2RUZ4 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
SMIM1B2RUZ4 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
SMIM1B2RUZ4 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
SMIM1B2RUZ4 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
SMIM1B2RUZ4 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.53
SMIM1B2RUZ4 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
SMIM1B2RUZ4 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
SMIM1B2RUZ4 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
SMIM1B2RUZ4 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
SMIM1B2RUZ4 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
SMIM1B2RUZ4 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
SMIM1B2RUZ4 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
SMIM1B2RUZ4 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
SMIM1B2RUZ4 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
SMIM1B2RUZ4 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.54
SMIM1B2RUZ4 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
SMIM1B2RUZ4 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.54
SMIM1B2RUZ4 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
SMIM1B2RUZ4 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
SMIM1B2RUZ4 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
SMIM1B2RUZ4 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.54
SMIM1B2RUZ4 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
SMIM1B2RUZ4 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
SMIM1B2RUZ4 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
SMIM1B2RUZ4 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.54
SMIM1B2RUZ4 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
SMIM1B2RUZ4 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
SMIM1B2RUZ4 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.54
SMIM1B2RUZ4 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
SMIM1B2RUZ4 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
SMIM1B2RUZ4 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
SMIM1B2RUZ4 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
SMIM1B2RUZ4 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC11.71□□□□□ -0.54
SMIM1B2RUZ4 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SMIM1B2RUZ4 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SMIM1B2RUZ4 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SMIM1B2RUZ4 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SMIM1B2RUZ4 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SMIM1B2RUZ4 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SMIM1B2RUZ4 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SMIM1B2RUZ4 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SMIM1B2RUZ4 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SMIM1B2RUZ4 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SMIM1B2RUZ4 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SMIM1B2RUZ4 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SMIM1B2RUZ4 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SMIM1B2RUZ4 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SMIM1B2RUZ4 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SMIM1B2RUZ4 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SMIM1B2RUZ4 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SMIM1B2RUZ4 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SMIM1B2RUZ4 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SMIM1B2RUZ4 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SMIM1B2RUZ4 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SMIM1B2RUZ4 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SMIM1B2RUZ4 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SMIM1B2RUZ4 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
SMIM1B2RUZ4 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms