Protein–RNA interactions for Protein: A6NFI3

ZNF316, Zinc finger protein 316, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF316A6NFI3 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
ZNF316A6NFI3 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ZNF316A6NFI3 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
ZNF316A6NFI3 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ZNF316A6NFI3 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ZNF316A6NFI3 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ZNF316A6NFI3 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
ZNF316A6NFI3 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ZNF316A6NFI3 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ZNF316A6NFI3 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ZNF316A6NFI3 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ZNF316A6NFI3 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ZNF316A6NFI3 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ZNF316A6NFI3 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ZNF316A6NFI3 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ZNF316A6NFI3 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ZNF316A6NFI3 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
ZNF316A6NFI3 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ZNF316A6NFI3 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ZNF316A6NFI3 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ZNF316A6NFI3 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ZNF316A6NFI3 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ZNF316A6NFI3 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ZNF316A6NFI3 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ZNF316A6NFI3 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ZNF316A6NFI3 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ZNF316A6NFI3 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ZNF316A6NFI3 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ZNF316A6NFI3 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ZNF316A6NFI3 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ZNF316A6NFI3 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ZNF316A6NFI3 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ZNF316A6NFI3 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ZNF316A6NFI3 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ZNF316A6NFI3 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ZNF316A6NFI3 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ZNF316A6NFI3 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
ZNF316A6NFI3 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ZNF316A6NFI3 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ZNF316A6NFI3 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ZNF316A6NFI3 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ZNF316A6NFI3 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ZNF316A6NFI3 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
ZNF316A6NFI3 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
ZNF316A6NFI3 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
ZNF316A6NFI3 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
ZNF316A6NFI3 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
ZNF316A6NFI3 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZNF316A6NFI3 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZNF316A6NFI3 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZNF316A6NFI3 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZNF316A6NFI3 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZNF316A6NFI3 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZNF316A6NFI3 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZNF316A6NFI3 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZNF316A6NFI3 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZNF316A6NFI3 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZNF316A6NFI3 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
ZNF316A6NFI3 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
ZNF316A6NFI3 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
ZNF316A6NFI3 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZNF316A6NFI3 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZNF316A6NFI3 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZNF316A6NFI3 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZNF316A6NFI3 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZNF316A6NFI3 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
ZNF316A6NFI3 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZNF316A6NFI3 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZNF316A6NFI3 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
ZNF316A6NFI3 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZNF316A6NFI3 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZNF316A6NFI3 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZNF316A6NFI3 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZNF316A6NFI3 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZNF316A6NFI3 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZNF316A6NFI3 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZNF316A6NFI3 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZNF316A6NFI3 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZNF316A6NFI3 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
ZNF316A6NFI3 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZNF316A6NFI3 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZNF316A6NFI3 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZNF316A6NFI3 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZNF316A6NFI3 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZNF316A6NFI3 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZNF316A6NFI3 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZNF316A6NFI3 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZNF316A6NFI3 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZNF316A6NFI3 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZNF316A6NFI3 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZNF316A6NFI3 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZNF316A6NFI3 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZNF316A6NFI3 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZNF316A6NFI3 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
ZNF316A6NFI3 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZNF316A6NFI3 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZNF316A6NFI3 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZNF316A6NFI3 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZNF316A6NFI3 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZNF316A6NFI3 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms