Protein–RNA interactions for Protein: A6NCF5

KLHL33, Kelch-like protein 33, humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL33A6NCF5 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLHL33A6NCF5 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KLHL33A6NCF5 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KLHL33A6NCF5 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KLHL33A6NCF5 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
KLHL33A6NCF5 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
KLHL33A6NCF5 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KLHL33A6NCF5 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
KLHL33A6NCF5 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
KLHL33A6NCF5 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
KLHL33A6NCF5 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KLHL33A6NCF5 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
KLHL33A6NCF5 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
KLHL33A6NCF5 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KLHL33A6NCF5 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
KLHL33A6NCF5 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
KLHL33A6NCF5 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KLHL33A6NCF5 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
KLHL33A6NCF5 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KLHL33A6NCF5 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KLHL33A6NCF5 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KLHL33A6NCF5 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
KLHL33A6NCF5 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
KLHL33A6NCF5 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
KLHL33A6NCF5 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
KLHL33A6NCF5 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KLHL33A6NCF5 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KLHL33A6NCF5 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KLHL33A6NCF5 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
KLHL33A6NCF5 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
KLHL33A6NCF5 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
KLHL33A6NCF5 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
KLHL33A6NCF5 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
KLHL33A6NCF5 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
KLHL33A6NCF5 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
KLHL33A6NCF5 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
KLHL33A6NCF5 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
KLHL33A6NCF5 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
KLHL33A6NCF5 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
KLHL33A6NCF5 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
KLHL33A6NCF5 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
KLHL33A6NCF5 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
KLHL33A6NCF5 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
KLHL33A6NCF5 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
KLHL33A6NCF5 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
KLHL33A6NCF5 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
KLHL33A6NCF5 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
KLHL33A6NCF5 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
KLHL33A6NCF5 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
KLHL33A6NCF5 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
KLHL33A6NCF5 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
KLHL33A6NCF5 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
KLHL33A6NCF5 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
KLHL33A6NCF5 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
KLHL33A6NCF5 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
KLHL33A6NCF5 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
KLHL33A6NCF5 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
KLHL33A6NCF5 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
KLHL33A6NCF5 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
KLHL33A6NCF5 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
KLHL33A6NCF5 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
KLHL33A6NCF5 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
KLHL33A6NCF5 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
KLHL33A6NCF5 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
KLHL33A6NCF5 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
KLHL33A6NCF5 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
KLHL33A6NCF5 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
KLHL33A6NCF5 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
KLHL33A6NCF5 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
KLHL33A6NCF5 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
KLHL33A6NCF5 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
KLHL33A6NCF5 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
KLHL33A6NCF5 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
KLHL33A6NCF5 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
KLHL33A6NCF5 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
KLHL33A6NCF5 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
KLHL33A6NCF5 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
KLHL33A6NCF5 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
KLHL33A6NCF5 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
KLHL33A6NCF5 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
KLHL33A6NCF5 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
KLHL33A6NCF5 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
KLHL33A6NCF5 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
KLHL33A6NCF5 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
KLHL33A6NCF5 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
KLHL33A6NCF5 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
KLHL33A6NCF5 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
KLHL33A6NCF5 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
KLHL33A6NCF5 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
KLHL33A6NCF5 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
KLHL33A6NCF5 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
KLHL33A6NCF5 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
KLHL33A6NCF5 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
KLHL33A6NCF5 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
KLHL33A6NCF5 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
KLHL33A6NCF5 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
KLHL33A6NCF5 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
KLHL33A6NCF5 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
KLHL33A6NCF5 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
KLHL33A6NCF5 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms