Protein–RNA interactions for Protein: A2RTX5

TARSL2, Probable threonine--tRNA ligase 2, cytoplasmic, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 802 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TARSL2A2RTX5 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TARSL2A2RTX5 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TARSL2A2RTX5 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
TARSL2A2RTX5 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TARSL2A2RTX5 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TARSL2A2RTX5 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
TARSL2A2RTX5 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TARSL2A2RTX5 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TARSL2A2RTX5 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TARSL2A2RTX5 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TARSL2A2RTX5 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TARSL2A2RTX5 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TARSL2A2RTX5 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TARSL2A2RTX5 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TARSL2A2RTX5 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TARSL2A2RTX5 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TARSL2A2RTX5 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TARSL2A2RTX5 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TARSL2A2RTX5 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TARSL2A2RTX5 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
TARSL2A2RTX5 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TARSL2A2RTX5 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TARSL2A2RTX5 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TARSL2A2RTX5 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TARSL2A2RTX5 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TARSL2A2RTX5 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TARSL2A2RTX5 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TARSL2A2RTX5 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
TARSL2A2RTX5 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
TARSL2A2RTX5 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TARSL2A2RTX5 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TARSL2A2RTX5 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TARSL2A2RTX5 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TARSL2A2RTX5 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TARSL2A2RTX5 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TARSL2A2RTX5 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TARSL2A2RTX5 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TARSL2A2RTX5 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TARSL2A2RTX5 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TARSL2A2RTX5 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TARSL2A2RTX5 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TARSL2A2RTX5 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TARSL2A2RTX5 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TARSL2A2RTX5 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TARSL2A2RTX5 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TARSL2A2RTX5 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TARSL2A2RTX5 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TARSL2A2RTX5 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TARSL2A2RTX5 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TARSL2A2RTX5 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TARSL2A2RTX5 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TARSL2A2RTX5 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TARSL2A2RTX5 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TARSL2A2RTX5 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TARSL2A2RTX5 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TARSL2A2RTX5 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TARSL2A2RTX5 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TARSL2A2RTX5 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TARSL2A2RTX5 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TARSL2A2RTX5 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TARSL2A2RTX5 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TARSL2A2RTX5 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TARSL2A2RTX5 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TARSL2A2RTX5 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TARSL2A2RTX5 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TARSL2A2RTX5 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
TARSL2A2RTX5 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TARSL2A2RTX5 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TARSL2A2RTX5 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TARSL2A2RTX5 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TARSL2A2RTX5 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TARSL2A2RTX5 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TARSL2A2RTX5 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TARSL2A2RTX5 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
TARSL2A2RTX5 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TARSL2A2RTX5 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
TARSL2A2RTX5 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TARSL2A2RTX5 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TARSL2A2RTX5 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TARSL2A2RTX5 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TARSL2A2RTX5 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TARSL2A2RTX5 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TARSL2A2RTX5 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TARSL2A2RTX5 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TARSL2A2RTX5 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TARSL2A2RTX5 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TARSL2A2RTX5 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TARSL2A2RTX5 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TARSL2A2RTX5 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TARSL2A2RTX5 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TARSL2A2RTX5 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TARSL2A2RTX5 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TARSL2A2RTX5 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TARSL2A2RTX5 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TARSL2A2RTX5 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TARSL2A2RTX5 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TARSL2A2RTX5 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TARSL2A2RTX5 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TARSL2A2RTX5 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TARSL2A2RTX5 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms