Protein–RNA interactions for Protein: U3KPV4

A3GALT2, Alpha-1,3-galactosyltransferase 2, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A3GALT2U3KPV4 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
A3GALT2U3KPV4 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
A3GALT2U3KPV4 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
A3GALT2U3KPV4 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
A3GALT2U3KPV4 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
A3GALT2U3KPV4 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
A3GALT2U3KPV4 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
A3GALT2U3KPV4 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
A3GALT2U3KPV4 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
A3GALT2U3KPV4 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
A3GALT2U3KPV4 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
A3GALT2U3KPV4 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
A3GALT2U3KPV4 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
A3GALT2U3KPV4 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
A3GALT2U3KPV4 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
A3GALT2U3KPV4 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
A3GALT2U3KPV4 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
A3GALT2U3KPV4 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
A3GALT2U3KPV4 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
A3GALT2U3KPV4 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
A3GALT2U3KPV4 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
A3GALT2U3KPV4 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
A3GALT2U3KPV4 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
A3GALT2U3KPV4 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
A3GALT2U3KPV4 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
A3GALT2U3KPV4 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
A3GALT2U3KPV4 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
A3GALT2U3KPV4 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
A3GALT2U3KPV4 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
A3GALT2U3KPV4 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
A3GALT2U3KPV4 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
A3GALT2U3KPV4 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
A3GALT2U3KPV4 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
A3GALT2U3KPV4 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
A3GALT2U3KPV4 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
A3GALT2U3KPV4 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
A3GALT2U3KPV4 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
A3GALT2U3KPV4 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
A3GALT2U3KPV4 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
A3GALT2U3KPV4 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
A3GALT2U3KPV4 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
A3GALT2U3KPV4 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
A3GALT2U3KPV4 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
A3GALT2U3KPV4 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
A3GALT2U3KPV4 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
A3GALT2U3KPV4 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
A3GALT2U3KPV4 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
A3GALT2U3KPV4 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
A3GALT2U3KPV4 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
A3GALT2U3KPV4 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
A3GALT2U3KPV4 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
A3GALT2U3KPV4 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
A3GALT2U3KPV4 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
A3GALT2U3KPV4 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
A3GALT2U3KPV4 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
A3GALT2U3KPV4 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
A3GALT2U3KPV4 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
A3GALT2U3KPV4 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
A3GALT2U3KPV4 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
A3GALT2U3KPV4 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
A3GALT2U3KPV4 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
A3GALT2U3KPV4 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
A3GALT2U3KPV4 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
A3GALT2U3KPV4 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
A3GALT2U3KPV4 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
A3GALT2U3KPV4 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
A3GALT2U3KPV4 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
A3GALT2U3KPV4 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
A3GALT2U3KPV4 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
A3GALT2U3KPV4 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
A3GALT2U3KPV4 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
A3GALT2U3KPV4 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
A3GALT2U3KPV4 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
A3GALT2U3KPV4 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
A3GALT2U3KPV4 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
A3GALT2U3KPV4 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
A3GALT2U3KPV4 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
A3GALT2U3KPV4 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
A3GALT2U3KPV4 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
A3GALT2U3KPV4 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
A3GALT2U3KPV4 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
A3GALT2U3KPV4 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
A3GALT2U3KPV4 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
A3GALT2U3KPV4 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
A3GALT2U3KPV4 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
A3GALT2U3KPV4 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
A3GALT2U3KPV4 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
A3GALT2U3KPV4 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
A3GALT2U3KPV4 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
A3GALT2U3KPV4 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
A3GALT2U3KPV4 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
A3GALT2U3KPV4 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
A3GALT2U3KPV4 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
A3GALT2U3KPV4 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
A3GALT2U3KPV4 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
A3GALT2U3KPV4 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
A3GALT2U3KPV4 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
A3GALT2U3KPV4 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
A3GALT2U3KPV4 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
A3GALT2U3KPV4 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms