Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3B3

TMED7, Transmembrane emp24 domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMED7Q9Y3B3 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMED7Q9Y3B3 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMED7Q9Y3B3 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMED7Q9Y3B3 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMED7Q9Y3B3 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMED7Q9Y3B3 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMED7Q9Y3B3 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMED7Q9Y3B3 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
TMED7Q9Y3B3 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMED7Q9Y3B3 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMED7Q9Y3B3 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMED7Q9Y3B3 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMED7Q9Y3B3 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMED7Q9Y3B3 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMED7Q9Y3B3 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMED7Q9Y3B3 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
TMED7Q9Y3B3 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
TMED7Q9Y3B3 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMED7Q9Y3B3 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMED7Q9Y3B3 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMED7Q9Y3B3 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMED7Q9Y3B3 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMED7Q9Y3B3 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMED7Q9Y3B3 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMED7Q9Y3B3 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMED7Q9Y3B3 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMED7Q9Y3B3 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMED7Q9Y3B3 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMED7Q9Y3B3 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMED7Q9Y3B3 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMED7Q9Y3B3 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMED7Q9Y3B3 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
TMED7Q9Y3B3 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
TMED7Q9Y3B3 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
TMED7Q9Y3B3 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
TMED7Q9Y3B3 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.1
TMED7Q9Y3B3 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMED7Q9Y3B3 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMED7Q9Y3B3 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMED7Q9Y3B3 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMED7Q9Y3B3 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMED7Q9Y3B3 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMED7Q9Y3B3 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMED7Q9Y3B3 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMED7Q9Y3B3 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMED7Q9Y3B3 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMED7Q9Y3B3 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMED7Q9Y3B3 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMED7Q9Y3B3 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMED7Q9Y3B3 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMED7Q9Y3B3 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMED7Q9Y3B3 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMED7Q9Y3B3 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
TMED7Q9Y3B3 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMED7Q9Y3B3 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMED7Q9Y3B3 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMED7Q9Y3B3 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMED7Q9Y3B3 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMED7Q9Y3B3 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMED7Q9Y3B3 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMED7Q9Y3B3 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMED7Q9Y3B3 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMED7Q9Y3B3 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMED7Q9Y3B3 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMED7Q9Y3B3 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMED7Q9Y3B3 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMED7Q9Y3B3 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMED7Q9Y3B3 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMED7Q9Y3B3 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMED7Q9Y3B3 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMED7Q9Y3B3 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMED7Q9Y3B3 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMED7Q9Y3B3 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMED7Q9Y3B3 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMED7Q9Y3B3 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMED7Q9Y3B3 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TMED7Q9Y3B3 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TMED7Q9Y3B3 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TMED7Q9Y3B3 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TMED7Q9Y3B3 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TMED7Q9Y3B3 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TMED7Q9Y3B3 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TMED7Q9Y3B3 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TMED7Q9Y3B3 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TMED7Q9Y3B3 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TMED7Q9Y3B3 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TMED7Q9Y3B3 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TMED7Q9Y3B3 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
TMED7Q9Y3B3 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TMED7Q9Y3B3 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TMED7Q9Y3B3 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TMED7Q9Y3B3 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TMED7Q9Y3B3 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TMED7Q9Y3B3 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TMED7Q9Y3B3 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TMED7Q9Y3B3 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TMED7Q9Y3B3 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TMED7Q9Y3B3 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
TMED7Q9Y3B3 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TMED7Q9Y3B3 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms