Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2K6

USP20, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 20, humanhuman

Predictions only

Length 914 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP20Q9Y2K6 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
USP20Q9Y2K6 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
USP20Q9Y2K6 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.62
USP20Q9Y2K6 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
USP20Q9Y2K6 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
USP20Q9Y2K6 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
USP20Q9Y2K6 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
USP20Q9Y2K6 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
USP20Q9Y2K6 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
USP20Q9Y2K6 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
USP20Q9Y2K6 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
USP20Q9Y2K6 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
USP20Q9Y2K6 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
USP20Q9Y2K6 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
USP20Q9Y2K6 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
USP20Q9Y2K6 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
USP20Q9Y2K6 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
USP20Q9Y2K6 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
USP20Q9Y2K6 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
USP20Q9Y2K6 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
USP20Q9Y2K6 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
USP20Q9Y2K6 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
USP20Q9Y2K6 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
USP20Q9Y2K6 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
USP20Q9Y2K6 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
USP20Q9Y2K6 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
USP20Q9Y2K6 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
USP20Q9Y2K6 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
USP20Q9Y2K6 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
USP20Q9Y2K6 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
USP20Q9Y2K6 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
USP20Q9Y2K6 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
USP20Q9Y2K6 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
USP20Q9Y2K6 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
USP20Q9Y2K6 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
USP20Q9Y2K6 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
USP20Q9Y2K6 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
USP20Q9Y2K6 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
USP20Q9Y2K6 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
USP20Q9Y2K6 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
USP20Q9Y2K6 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
USP20Q9Y2K6 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
USP20Q9Y2K6 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
USP20Q9Y2K6 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
USP20Q9Y2K6 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
USP20Q9Y2K6 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
USP20Q9Y2K6 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
USP20Q9Y2K6 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
USP20Q9Y2K6 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
USP20Q9Y2K6 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
USP20Q9Y2K6 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
USP20Q9Y2K6 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
USP20Q9Y2K6 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
USP20Q9Y2K6 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
USP20Q9Y2K6 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
USP20Q9Y2K6 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
USP20Q9Y2K6 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
USP20Q9Y2K6 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
USP20Q9Y2K6 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
USP20Q9Y2K6 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
USP20Q9Y2K6 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
USP20Q9Y2K6 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
USP20Q9Y2K6 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
USP20Q9Y2K6 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
USP20Q9Y2K6 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
USP20Q9Y2K6 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
USP20Q9Y2K6 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
USP20Q9Y2K6 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
USP20Q9Y2K6 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
USP20Q9Y2K6 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
USP20Q9Y2K6 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
USP20Q9Y2K6 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
USP20Q9Y2K6 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
USP20Q9Y2K6 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
USP20Q9Y2K6 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
USP20Q9Y2K6 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
USP20Q9Y2K6 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
USP20Q9Y2K6 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
USP20Q9Y2K6 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
USP20Q9Y2K6 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
USP20Q9Y2K6 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
USP20Q9Y2K6 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
USP20Q9Y2K6 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
USP20Q9Y2K6 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
USP20Q9Y2K6 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
USP20Q9Y2K6 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
USP20Q9Y2K6 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
USP20Q9Y2K6 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
USP20Q9Y2K6 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
USP20Q9Y2K6 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
USP20Q9Y2K6 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
USP20Q9Y2K6 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
USP20Q9Y2K6 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
USP20Q9Y2K6 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
USP20Q9Y2K6 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
USP20Q9Y2K6 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
USP20Q9Y2K6 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
USP20Q9Y2K6 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
USP20Q9Y2K6 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
USP20Q9Y2K6 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
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