Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y285

FARSA, Phenylalanine--tRNA ligase alpha subunit, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FARSAQ9Y285 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
FARSAQ9Y285 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FARSAQ9Y285 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FARSAQ9Y285 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FARSAQ9Y285 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FARSAQ9Y285 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FARSAQ9Y285 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FARSAQ9Y285 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FARSAQ9Y285 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FARSAQ9Y285 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FARSAQ9Y285 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FARSAQ9Y285 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FARSAQ9Y285 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FARSAQ9Y285 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FARSAQ9Y285 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FARSAQ9Y285 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FARSAQ9Y285 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FARSAQ9Y285 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FARSAQ9Y285 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FARSAQ9Y285 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FARSAQ9Y285 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FARSAQ9Y285 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
FARSAQ9Y285 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
FARSAQ9Y285 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
FARSAQ9Y285 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
FARSAQ9Y285 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
FARSAQ9Y285 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
FARSAQ9Y285 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
FARSAQ9Y285 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
FARSAQ9Y285 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
FARSAQ9Y285 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
FARSAQ9Y285 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
FARSAQ9Y285 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
FARSAQ9Y285 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
FARSAQ9Y285 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
FARSAQ9Y285 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
FARSAQ9Y285 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
FARSAQ9Y285 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
FARSAQ9Y285 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
FARSAQ9Y285 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
FARSAQ9Y285 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
FARSAQ9Y285 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
FARSAQ9Y285 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
FARSAQ9Y285 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
FARSAQ9Y285 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
FARSAQ9Y285 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
FARSAQ9Y285 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
FARSAQ9Y285 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
FARSAQ9Y285 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
FARSAQ9Y285 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
FARSAQ9Y285 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
FARSAQ9Y285 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
FARSAQ9Y285 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
FARSAQ9Y285 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
FARSAQ9Y285 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
FARSAQ9Y285 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
FARSAQ9Y285 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
FARSAQ9Y285 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
FARSAQ9Y285 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
FARSAQ9Y285 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
FARSAQ9Y285 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
FARSAQ9Y285 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
FARSAQ9Y285 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
FARSAQ9Y285 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
FARSAQ9Y285 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
FARSAQ9Y285 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
FARSAQ9Y285 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
FARSAQ9Y285 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
FARSAQ9Y285 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
FARSAQ9Y285 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
FARSAQ9Y285 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
FARSAQ9Y285 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
FARSAQ9Y285 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
FARSAQ9Y285 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
FARSAQ9Y285 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
FARSAQ9Y285 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
FARSAQ9Y285 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
FARSAQ9Y285 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
FARSAQ9Y285 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
FARSAQ9Y285 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
FARSAQ9Y285 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
FARSAQ9Y285 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
FARSAQ9Y285 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
FARSAQ9Y285 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
FARSAQ9Y285 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
FARSAQ9Y285 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
FARSAQ9Y285 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
FARSAQ9Y285 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
FARSAQ9Y285 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
FARSAQ9Y285 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
FARSAQ9Y285 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
FARSAQ9Y285 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
FARSAQ9Y285 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
FARSAQ9Y285 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
FARSAQ9Y285 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
FARSAQ9Y285 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
FARSAQ9Y285 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
FARSAQ9Y285 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
FARSAQ9Y285 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
FARSAQ9Y285 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms