Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQ13

SHOC2, Leucine-rich repeat protein SHOC-2, humanhuman

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Length 582 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHOC2Q9UQ13 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SHOC2Q9UQ13 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SHOC2Q9UQ13 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SHOC2Q9UQ13 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SHOC2Q9UQ13 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SHOC2Q9UQ13 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
SHOC2Q9UQ13 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
SHOC2Q9UQ13 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SHOC2Q9UQ13 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SHOC2Q9UQ13 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SHOC2Q9UQ13 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SHOC2Q9UQ13 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SHOC2Q9UQ13 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SHOC2Q9UQ13 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
SHOC2Q9UQ13 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SHOC2Q9UQ13 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SHOC2Q9UQ13 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SHOC2Q9UQ13 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SHOC2Q9UQ13 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SHOC2Q9UQ13 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SHOC2Q9UQ13 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SHOC2Q9UQ13 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SHOC2Q9UQ13 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SHOC2Q9UQ13 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SHOC2Q9UQ13 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SHOC2Q9UQ13 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SHOC2Q9UQ13 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SHOC2Q9UQ13 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SHOC2Q9UQ13 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
SHOC2Q9UQ13 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SHOC2Q9UQ13 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SHOC2Q9UQ13 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SHOC2Q9UQ13 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SHOC2Q9UQ13 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SHOC2Q9UQ13 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SHOC2Q9UQ13 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SHOC2Q9UQ13 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SHOC2Q9UQ13 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SHOC2Q9UQ13 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SHOC2Q9UQ13 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SHOC2Q9UQ13 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SHOC2Q9UQ13 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SHOC2Q9UQ13 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SHOC2Q9UQ13 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
SHOC2Q9UQ13 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SHOC2Q9UQ13 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SHOC2Q9UQ13 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SHOC2Q9UQ13 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SHOC2Q9UQ13 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SHOC2Q9UQ13 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SHOC2Q9UQ13 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SHOC2Q9UQ13 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SHOC2Q9UQ13 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SHOC2Q9UQ13 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SHOC2Q9UQ13 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SHOC2Q9UQ13 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SHOC2Q9UQ13 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SHOC2Q9UQ13 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SHOC2Q9UQ13 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SHOC2Q9UQ13 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
SHOC2Q9UQ13 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SHOC2Q9UQ13 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SHOC2Q9UQ13 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SHOC2Q9UQ13 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
SHOC2Q9UQ13 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SHOC2Q9UQ13 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
SHOC2Q9UQ13 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SHOC2Q9UQ13 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SHOC2Q9UQ13 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SHOC2Q9UQ13 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SHOC2Q9UQ13 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SHOC2Q9UQ13 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SHOC2Q9UQ13 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SHOC2Q9UQ13 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SHOC2Q9UQ13 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SHOC2Q9UQ13 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SHOC2Q9UQ13 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SHOC2Q9UQ13 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SHOC2Q9UQ13 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SHOC2Q9UQ13 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SHOC2Q9UQ13 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SHOC2Q9UQ13 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SHOC2Q9UQ13 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SHOC2Q9UQ13 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SHOC2Q9UQ13 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SHOC2Q9UQ13 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SHOC2Q9UQ13 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SHOC2Q9UQ13 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SHOC2Q9UQ13 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SHOC2Q9UQ13 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SHOC2Q9UQ13 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SHOC2Q9UQ13 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SHOC2Q9UQ13 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SHOC2Q9UQ13 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SHOC2Q9UQ13 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SHOC2Q9UQ13 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SHOC2Q9UQ13 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SHOC2Q9UQ13 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SHOC2Q9UQ13 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SHOC2Q9UQ13 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
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