Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL63

MKLN1, Muskelin, humanhuman

Predictions only

Length 735 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKLN1Q9UL63 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MKLN1Q9UL63 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
MKLN1Q9UL63 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
MKLN1Q9UL63 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
MKLN1Q9UL63 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MKLN1Q9UL63 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MKLN1Q9UL63 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
MKLN1Q9UL63 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
MKLN1Q9UL63 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
MKLN1Q9UL63 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
MKLN1Q9UL63 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MKLN1Q9UL63 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MKLN1Q9UL63 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MKLN1Q9UL63 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MKLN1Q9UL63 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
MKLN1Q9UL63 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MKLN1Q9UL63 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MKLN1Q9UL63 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MKLN1Q9UL63 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MKLN1Q9UL63 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MKLN1Q9UL63 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MKLN1Q9UL63 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MKLN1Q9UL63 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MKLN1Q9UL63 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MKLN1Q9UL63 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MKLN1Q9UL63 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MKLN1Q9UL63 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MKLN1Q9UL63 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MKLN1Q9UL63 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MKLN1Q9UL63 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MKLN1Q9UL63 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
MKLN1Q9UL63 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MKLN1Q9UL63 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MKLN1Q9UL63 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MKLN1Q9UL63 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
MKLN1Q9UL63 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MKLN1Q9UL63 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MKLN1Q9UL63 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MKLN1Q9UL63 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MKLN1Q9UL63 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MKLN1Q9UL63 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MKLN1Q9UL63 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MKLN1Q9UL63 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MKLN1Q9UL63 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MKLN1Q9UL63 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MKLN1Q9UL63 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MKLN1Q9UL63 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MKLN1Q9UL63 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MKLN1Q9UL63 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MKLN1Q9UL63 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MKLN1Q9UL63 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MKLN1Q9UL63 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MKLN1Q9UL63 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MKLN1Q9UL63 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MKLN1Q9UL63 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MKLN1Q9UL63 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MKLN1Q9UL63 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MKLN1Q9UL63 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MKLN1Q9UL63 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MKLN1Q9UL63 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MKLN1Q9UL63 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MKLN1Q9UL63 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MKLN1Q9UL63 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MKLN1Q9UL63 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MKLN1Q9UL63 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MKLN1Q9UL63 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MKLN1Q9UL63 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MKLN1Q9UL63 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MKLN1Q9UL63 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
MKLN1Q9UL63 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MKLN1Q9UL63 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
MKLN1Q9UL63 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MKLN1Q9UL63 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MKLN1Q9UL63 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
MKLN1Q9UL63 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MKLN1Q9UL63 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MKLN1Q9UL63 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MKLN1Q9UL63 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
MKLN1Q9UL63 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MKLN1Q9UL63 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MKLN1Q9UL63 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MKLN1Q9UL63 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MKLN1Q9UL63 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MKLN1Q9UL63 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MKLN1Q9UL63 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MKLN1Q9UL63 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MKLN1Q9UL63 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MKLN1Q9UL63 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MKLN1Q9UL63 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MKLN1Q9UL63 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MKLN1Q9UL63 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MKLN1Q9UL63 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MKLN1Q9UL63 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MKLN1Q9UL63 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MKLN1Q9UL63 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
MKLN1Q9UL63 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MKLN1Q9UL63 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MKLN1Q9UL63 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MKLN1Q9UL63 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MKLN1Q9UL63 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms