Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIK5

TMEFF2, Tomoregulin-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEFF2Q9UIK5 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEFF2Q9UIK5 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEFF2Q9UIK5 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEFF2Q9UIK5 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEFF2Q9UIK5 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEFF2Q9UIK5 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEFF2Q9UIK5 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEFF2Q9UIK5 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEFF2Q9UIK5 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEFF2Q9UIK5 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEFF2Q9UIK5 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEFF2Q9UIK5 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEFF2Q9UIK5 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEFF2Q9UIK5 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEFF2Q9UIK5 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
TMEFF2Q9UIK5 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
TMEFF2Q9UIK5 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
TMEFF2Q9UIK5 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
TMEFF2Q9UIK5 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEFF2Q9UIK5 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEFF2Q9UIK5 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEFF2Q9UIK5 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEFF2Q9UIK5 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEFF2Q9UIK5 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEFF2Q9UIK5 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEFF2Q9UIK5 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEFF2Q9UIK5 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEFF2Q9UIK5 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEFF2Q9UIK5 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEFF2Q9UIK5 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEFF2Q9UIK5 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEFF2Q9UIK5 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEFF2Q9UIK5 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEFF2Q9UIK5 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEFF2Q9UIK5 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEFF2Q9UIK5 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEFF2Q9UIK5 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEFF2Q9UIK5 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEFF2Q9UIK5 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEFF2Q9UIK5 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEFF2Q9UIK5 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEFF2Q9UIK5 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEFF2Q9UIK5 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEFF2Q9UIK5 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEFF2Q9UIK5 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEFF2Q9UIK5 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEFF2Q9UIK5 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEFF2Q9UIK5 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEFF2Q9UIK5 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEFF2Q9UIK5 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEFF2Q9UIK5 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEFF2Q9UIK5 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEFF2Q9UIK5 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEFF2Q9UIK5 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEFF2Q9UIK5 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEFF2Q9UIK5 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEFF2Q9UIK5 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEFF2Q9UIK5 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEFF2Q9UIK5 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEFF2Q9UIK5 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEFF2Q9UIK5 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEFF2Q9UIK5 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEFF2Q9UIK5 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEFF2Q9UIK5 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEFF2Q9UIK5 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEFF2Q9UIK5 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEFF2Q9UIK5 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEFF2Q9UIK5 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEFF2Q9UIK5 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEFF2Q9UIK5 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEFF2Q9UIK5 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEFF2Q9UIK5 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEFF2Q9UIK5 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEFF2Q9UIK5 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEFF2Q9UIK5 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEFF2Q9UIK5 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEFF2Q9UIK5 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEFF2Q9UIK5 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEFF2Q9UIK5 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEFF2Q9UIK5 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEFF2Q9UIK5 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEFF2Q9UIK5 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEFF2Q9UIK5 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEFF2Q9UIK5 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEFF2Q9UIK5 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEFF2Q9UIK5 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEFF2Q9UIK5 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEFF2Q9UIK5 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEFF2Q9UIK5 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEFF2Q9UIK5 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEFF2Q9UIK5 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEFF2Q9UIK5 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEFF2Q9UIK5 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEFF2Q9UIK5 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEFF2Q9UIK5 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEFF2Q9UIK5 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEFF2Q9UIK5 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEFF2Q9UIK5 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEFF2Q9UIK5 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEFF2Q9UIK5 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms