Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2J2

IGSF9, Protein turtle homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF9Q9P2J2 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
IGSF9Q9P2J2 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
IGSF9Q9P2J2 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
IGSF9Q9P2J2 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
IGSF9Q9P2J2 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
IGSF9Q9P2J2 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
IGSF9Q9P2J2 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
IGSF9Q9P2J2 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
IGSF9Q9P2J2 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
IGSF9Q9P2J2 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
IGSF9Q9P2J2 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
IGSF9Q9P2J2 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
IGSF9Q9P2J2 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
IGSF9Q9P2J2 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
IGSF9Q9P2J2 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
IGSF9Q9P2J2 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
IGSF9Q9P2J2 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
IGSF9Q9P2J2 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
IGSF9Q9P2J2 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
IGSF9Q9P2J2 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
IGSF9Q9P2J2 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
IGSF9Q9P2J2 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
IGSF9Q9P2J2 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
IGSF9Q9P2J2 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
IGSF9Q9P2J2 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
IGSF9Q9P2J2 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
IGSF9Q9P2J2 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
IGSF9Q9P2J2 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
IGSF9Q9P2J2 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
IGSF9Q9P2J2 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
IGSF9Q9P2J2 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
IGSF9Q9P2J2 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
IGSF9Q9P2J2 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
IGSF9Q9P2J2 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
IGSF9Q9P2J2 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
IGSF9Q9P2J2 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
IGSF9Q9P2J2 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
IGSF9Q9P2J2 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
IGSF9Q9P2J2 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
IGSF9Q9P2J2 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
IGSF9Q9P2J2 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
IGSF9Q9P2J2 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
IGSF9Q9P2J2 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
IGSF9Q9P2J2 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
IGSF9Q9P2J2 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
IGSF9Q9P2J2 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
IGSF9Q9P2J2 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
IGSF9Q9P2J2 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
IGSF9Q9P2J2 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
IGSF9Q9P2J2 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
IGSF9Q9P2J2 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
IGSF9Q9P2J2 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
IGSF9Q9P2J2 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
IGSF9Q9P2J2 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
IGSF9Q9P2J2 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
IGSF9Q9P2J2 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
IGSF9Q9P2J2 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
IGSF9Q9P2J2 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
IGSF9Q9P2J2 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
IGSF9Q9P2J2 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
IGSF9Q9P2J2 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
IGSF9Q9P2J2 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
IGSF9Q9P2J2 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
IGSF9Q9P2J2 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
IGSF9Q9P2J2 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
IGSF9Q9P2J2 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
IGSF9Q9P2J2 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
IGSF9Q9P2J2 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
IGSF9Q9P2J2 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
IGSF9Q9P2J2 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
IGSF9Q9P2J2 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
IGSF9Q9P2J2 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
IGSF9Q9P2J2 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
IGSF9Q9P2J2 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
IGSF9Q9P2J2 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
IGSF9Q9P2J2 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
IGSF9Q9P2J2 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
IGSF9Q9P2J2 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
IGSF9Q9P2J2 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
IGSF9Q9P2J2 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
IGSF9Q9P2J2 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
IGSF9Q9P2J2 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
IGSF9Q9P2J2 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
IGSF9Q9P2J2 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
IGSF9Q9P2J2 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
IGSF9Q9P2J2 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
IGSF9Q9P2J2 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
IGSF9Q9P2J2 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
IGSF9Q9P2J2 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
IGSF9Q9P2J2 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
IGSF9Q9P2J2 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
IGSF9Q9P2J2 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
IGSF9Q9P2J2 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
IGSF9Q9P2J2 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
IGSF9Q9P2J2 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
IGSF9Q9P2J2 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
IGSF9Q9P2J2 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
IGSF9Q9P2J2 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
IGSF9Q9P2J2 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
IGSF9Q9P2J2 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms