Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0M6

H2AFY2, Core histone macro-H2A.2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2AFY2Q9P0M6 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2AFY2Q9P0M6 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2AFY2Q9P0M6 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2AFY2Q9P0M6 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2AFY2Q9P0M6 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2AFY2Q9P0M6 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2AFY2Q9P0M6 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2AFY2Q9P0M6 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2AFY2Q9P0M6 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2AFY2Q9P0M6 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2AFY2Q9P0M6 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2AFY2Q9P0M6 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
H2AFY2Q9P0M6 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
H2AFY2Q9P0M6 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
H2AFY2Q9P0M6 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
H2AFY2Q9P0M6 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
H2AFY2Q9P0M6 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
H2AFY2Q9P0M6 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
H2AFY2Q9P0M6 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
H2AFY2Q9P0M6 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
H2AFY2Q9P0M6 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
H2AFY2Q9P0M6 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
H2AFY2Q9P0M6 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
H2AFY2Q9P0M6 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
H2AFY2Q9P0M6 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
H2AFY2Q9P0M6 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
H2AFY2Q9P0M6 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
H2AFY2Q9P0M6 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
H2AFY2Q9P0M6 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
H2AFY2Q9P0M6 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
H2AFY2Q9P0M6 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
H2AFY2Q9P0M6 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
H2AFY2Q9P0M6 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
H2AFY2Q9P0M6 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
H2AFY2Q9P0M6 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
H2AFY2Q9P0M6 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
H2AFY2Q9P0M6 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
H2AFY2Q9P0M6 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
H2AFY2Q9P0M6 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
H2AFY2Q9P0M6 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
H2AFY2Q9P0M6 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
H2AFY2Q9P0M6 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
H2AFY2Q9P0M6 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
H2AFY2Q9P0M6 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
H2AFY2Q9P0M6 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
H2AFY2Q9P0M6 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
H2AFY2Q9P0M6 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
H2AFY2Q9P0M6 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
H2AFY2Q9P0M6 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
H2AFY2Q9P0M6 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
H2AFY2Q9P0M6 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
H2AFY2Q9P0M6 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
H2AFY2Q9P0M6 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
H2AFY2Q9P0M6 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
H2AFY2Q9P0M6 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
H2AFY2Q9P0M6 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
H2AFY2Q9P0M6 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
H2AFY2Q9P0M6 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
H2AFY2Q9P0M6 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
H2AFY2Q9P0M6 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
H2AFY2Q9P0M6 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2AFY2Q9P0M6 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2AFY2Q9P0M6 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2AFY2Q9P0M6 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2AFY2Q9P0M6 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2AFY2Q9P0M6 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2AFY2Q9P0M6 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2AFY2Q9P0M6 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2AFY2Q9P0M6 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2AFY2Q9P0M6 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2AFY2Q9P0M6 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2AFY2Q9P0M6 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
H2AFY2Q9P0M6 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2AFY2Q9P0M6 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2AFY2Q9P0M6 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2AFY2Q9P0M6 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2AFY2Q9P0M6 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2AFY2Q9P0M6 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2AFY2Q9P0M6 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2AFY2Q9P0M6 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2AFY2Q9P0M6 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2AFY2Q9P0M6 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2AFY2Q9P0M6 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2AFY2Q9P0M6 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2AFY2Q9P0M6 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
H2AFY2Q9P0M6 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2AFY2Q9P0M6 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
H2AFY2Q9P0M6 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2AFY2Q9P0M6 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2AFY2Q9P0M6 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2AFY2Q9P0M6 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2AFY2Q9P0M6 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2AFY2Q9P0M6 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
H2AFY2Q9P0M6 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2AFY2Q9P0M6 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2AFY2Q9P0M6 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2AFY2Q9P0M6 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2AFY2Q9P0M6 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2AFY2Q9P0M6 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2AFY2Q9P0M6 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms