Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWW5

CLN6, Ceroid-lipofuscinosis neuronal protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN6Q9NWW5 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CLN6Q9NWW5 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CLN6Q9NWW5 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CLN6Q9NWW5 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CLN6Q9NWW5 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CLN6Q9NWW5 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CLN6Q9NWW5 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CLN6Q9NWW5 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CLN6Q9NWW5 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CLN6Q9NWW5 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CLN6Q9NWW5 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CLN6Q9NWW5 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CLN6Q9NWW5 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CLN6Q9NWW5 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CLN6Q9NWW5 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CLN6Q9NWW5 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CLN6Q9NWW5 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CLN6Q9NWW5 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CLN6Q9NWW5 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CLN6Q9NWW5 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CLN6Q9NWW5 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CLN6Q9NWW5 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CLN6Q9NWW5 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CLN6Q9NWW5 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CLN6Q9NWW5 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CLN6Q9NWW5 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CLN6Q9NWW5 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CLN6Q9NWW5 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CLN6Q9NWW5 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CLN6Q9NWW5 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CLN6Q9NWW5 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CLN6Q9NWW5 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CLN6Q9NWW5 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CLN6Q9NWW5 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CLN6Q9NWW5 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CLN6Q9NWW5 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CLN6Q9NWW5 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CLN6Q9NWW5 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CLN6Q9NWW5 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CLN6Q9NWW5 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CLN6Q9NWW5 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CLN6Q9NWW5 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CLN6Q9NWW5 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CLN6Q9NWW5 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CLN6Q9NWW5 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CLN6Q9NWW5 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CLN6Q9NWW5 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CLN6Q9NWW5 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CLN6Q9NWW5 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CLN6Q9NWW5 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CLN6Q9NWW5 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CLN6Q9NWW5 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CLN6Q9NWW5 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CLN6Q9NWW5 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CLN6Q9NWW5 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CLN6Q9NWW5 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CLN6Q9NWW5 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CLN6Q9NWW5 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CLN6Q9NWW5 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CLN6Q9NWW5 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CLN6Q9NWW5 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CLN6Q9NWW5 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CLN6Q9NWW5 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CLN6Q9NWW5 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CLN6Q9NWW5 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CLN6Q9NWW5 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CLN6Q9NWW5 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CLN6Q9NWW5 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CLN6Q9NWW5 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CLN6Q9NWW5 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CLN6Q9NWW5 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CLN6Q9NWW5 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
CLN6Q9NWW5 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CLN6Q9NWW5 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CLN6Q9NWW5 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CLN6Q9NWW5 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CLN6Q9NWW5 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CLN6Q9NWW5 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CLN6Q9NWW5 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CLN6Q9NWW5 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CLN6Q9NWW5 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CLN6Q9NWW5 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
CLN6Q9NWW5 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CLN6Q9NWW5 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CLN6Q9NWW5 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CLN6Q9NWW5 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CLN6Q9NWW5 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CLN6Q9NWW5 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CLN6Q9NWW5 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CLN6Q9NWW5 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CLN6Q9NWW5 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CLN6Q9NWW5 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CLN6Q9NWW5 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CLN6Q9NWW5 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CLN6Q9NWW5 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CLN6Q9NWW5 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CLN6Q9NWW5 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CLN6Q9NWW5 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CLN6Q9NWW5 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CLN6Q9NWW5 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms