Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRS6

SNX15, Sorting nexin-15, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX15Q9NRS6 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SNX15Q9NRS6 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SNX15Q9NRS6 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SNX15Q9NRS6 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SNX15Q9NRS6 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SNX15Q9NRS6 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SNX15Q9NRS6 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SNX15Q9NRS6 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SNX15Q9NRS6 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SNX15Q9NRS6 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SNX15Q9NRS6 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SNX15Q9NRS6 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SNX15Q9NRS6 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SNX15Q9NRS6 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SNX15Q9NRS6 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SNX15Q9NRS6 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SNX15Q9NRS6 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SNX15Q9NRS6 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SNX15Q9NRS6 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SNX15Q9NRS6 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SNX15Q9NRS6 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SNX15Q9NRS6 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SNX15Q9NRS6 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SNX15Q9NRS6 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SNX15Q9NRS6 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SNX15Q9NRS6 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SNX15Q9NRS6 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SNX15Q9NRS6 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SNX15Q9NRS6 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SNX15Q9NRS6 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SNX15Q9NRS6 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SNX15Q9NRS6 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SNX15Q9NRS6 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SNX15Q9NRS6 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SNX15Q9NRS6 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SNX15Q9NRS6 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SNX15Q9NRS6 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SNX15Q9NRS6 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SNX15Q9NRS6 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SNX15Q9NRS6 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SNX15Q9NRS6 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SNX15Q9NRS6 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SNX15Q9NRS6 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SNX15Q9NRS6 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SNX15Q9NRS6 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SNX15Q9NRS6 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SNX15Q9NRS6 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SNX15Q9NRS6 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SNX15Q9NRS6 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SNX15Q9NRS6 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SNX15Q9NRS6 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SNX15Q9NRS6 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SNX15Q9NRS6 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SNX15Q9NRS6 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SNX15Q9NRS6 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SNX15Q9NRS6 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SNX15Q9NRS6 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SNX15Q9NRS6 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SNX15Q9NRS6 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SNX15Q9NRS6 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SNX15Q9NRS6 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
SNX15Q9NRS6 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SNX15Q9NRS6 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
SNX15Q9NRS6 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SNX15Q9NRS6 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SNX15Q9NRS6 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SNX15Q9NRS6 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SNX15Q9NRS6 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SNX15Q9NRS6 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SNX15Q9NRS6 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
SNX15Q9NRS6 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
SNX15Q9NRS6 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
SNX15Q9NRS6 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNX15Q9NRS6 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNX15Q9NRS6 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNX15Q9NRS6 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNX15Q9NRS6 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNX15Q9NRS6 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNX15Q9NRS6 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNX15Q9NRS6 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SNX15Q9NRS6 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNX15Q9NRS6 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SNX15Q9NRS6 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNX15Q9NRS6 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNX15Q9NRS6 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNX15Q9NRS6 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNX15Q9NRS6 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNX15Q9NRS6 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNX15Q9NRS6 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNX15Q9NRS6 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNX15Q9NRS6 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNX15Q9NRS6 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNX15Q9NRS6 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNX15Q9NRS6 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNX15Q9NRS6 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNX15Q9NRS6 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNX15Q9NRS6 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNX15Q9NRS6 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNX15Q9NRS6 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SNX15Q9NRS6 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms