Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPI8

FANCF, Fanconi anemia group F protein, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCFQ9NPI8 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FANCFQ9NPI8 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FANCFQ9NPI8 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
FANCFQ9NPI8 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
FANCFQ9NPI8 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
FANCFQ9NPI8 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FANCFQ9NPI8 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FANCFQ9NPI8 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FANCFQ9NPI8 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FANCFQ9NPI8 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FANCFQ9NPI8 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FANCFQ9NPI8 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FANCFQ9NPI8 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FANCFQ9NPI8 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FANCFQ9NPI8 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FANCFQ9NPI8 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FANCFQ9NPI8 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FANCFQ9NPI8 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FANCFQ9NPI8 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FANCFQ9NPI8 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FANCFQ9NPI8 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FANCFQ9NPI8 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FANCFQ9NPI8 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FANCFQ9NPI8 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FANCFQ9NPI8 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FANCFQ9NPI8 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FANCFQ9NPI8 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FANCFQ9NPI8 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FANCFQ9NPI8 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FANCFQ9NPI8 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FANCFQ9NPI8 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FANCFQ9NPI8 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FANCFQ9NPI8 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FANCFQ9NPI8 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FANCFQ9NPI8 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FANCFQ9NPI8 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FANCFQ9NPI8 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FANCFQ9NPI8 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FANCFQ9NPI8 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FANCFQ9NPI8 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FANCFQ9NPI8 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FANCFQ9NPI8 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FANCFQ9NPI8 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FANCFQ9NPI8 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FANCFQ9NPI8 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FANCFQ9NPI8 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FANCFQ9NPI8 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FANCFQ9NPI8 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FANCFQ9NPI8 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FANCFQ9NPI8 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FANCFQ9NPI8 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FANCFQ9NPI8 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FANCFQ9NPI8 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FANCFQ9NPI8 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FANCFQ9NPI8 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FANCFQ9NPI8 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FANCFQ9NPI8 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FANCFQ9NPI8 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FANCFQ9NPI8 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FANCFQ9NPI8 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FANCFQ9NPI8 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FANCFQ9NPI8 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FANCFQ9NPI8 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FANCFQ9NPI8 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FANCFQ9NPI8 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FANCFQ9NPI8 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FANCFQ9NPI8 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FANCFQ9NPI8 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FANCFQ9NPI8 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FANCFQ9NPI8 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FANCFQ9NPI8 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
FANCFQ9NPI8 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FANCFQ9NPI8 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FANCFQ9NPI8 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FANCFQ9NPI8 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FANCFQ9NPI8 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FANCFQ9NPI8 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FANCFQ9NPI8 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FANCFQ9NPI8 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FANCFQ9NPI8 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
FANCFQ9NPI8 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
FANCFQ9NPI8 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
FANCFQ9NPI8 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
FANCFQ9NPI8 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
FANCFQ9NPI8 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
FANCFQ9NPI8 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
FANCFQ9NPI8 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
FANCFQ9NPI8 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
FANCFQ9NPI8 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
FANCFQ9NPI8 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
FANCFQ9NPI8 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
FANCFQ9NPI8 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
FANCFQ9NPI8 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
FANCFQ9NPI8 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
FANCFQ9NPI8 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
FANCFQ9NPI8 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
FANCFQ9NPI8 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
FANCFQ9NPI8 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
FANCFQ9NPI8 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
FANCFQ9NPI8 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
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