Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW3

SNHG12, Putative uncharacterized protein SNHG12, humanhuman

Predictions only

Length 62 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNHG12Q9BXW3 LIG1-203ENST00000536218 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
SNHG12Q9BXW3 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
SNHG12Q9BXW3 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
SNHG12Q9BXW3 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
SNHG12Q9BXW3 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
SNHG12Q9BXW3 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
SNHG12Q9BXW3 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
SNHG12Q9BXW3 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
SNHG12Q9BXW3 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
SNHG12Q9BXW3 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
SNHG12Q9BXW3 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
SNHG12Q9BXW3 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
SNHG12Q9BXW3 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
SNHG12Q9BXW3 XKRX-202ENST00000468904 2249 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
SNHG12Q9BXW3 MINDY1-207ENST00000622754 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
SNHG12Q9BXW3 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
SNHG12Q9BXW3 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
SNHG12Q9BXW3 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
SNHG12Q9BXW3 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
SNHG12Q9BXW3 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
SNHG12Q9BXW3 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
SNHG12Q9BXW3 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
SNHG12Q9BXW3 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
SNHG12Q9BXW3 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
SNHG12Q9BXW3 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
SNHG12Q9BXW3 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
SNHG12Q9BXW3 FOXF1-201ENST00000262426 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
SNHG12Q9BXW3 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
SNHG12Q9BXW3 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
SNHG12Q9BXW3 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
SNHG12Q9BXW3 POLM-202ENST00000335195 2444 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
SNHG12Q9BXW3 C17orf53-201ENST00000245382 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
SNHG12Q9BXW3 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
SNHG12Q9BXW3 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
SNHG12Q9BXW3 PRRT2-201ENST00000300797 3002 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.43
SNHG12Q9BXW3 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
SNHG12Q9BXW3 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC12.4□□□□□ -0.43
SNHG12Q9BXW3 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
SNHG12Q9BXW3 AC113189.2-201ENST00000575310 1975 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
SNHG12Q9BXW3 MLLT6-211ENST00000621332 7578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
SNHG12Q9BXW3 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
SNHG12Q9BXW3 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
SNHG12Q9BXW3 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
SNHG12Q9BXW3 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
SNHG12Q9BXW3 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
SNHG12Q9BXW3 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
SNHG12Q9BXW3 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
SNHG12Q9BXW3 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
SNHG12Q9BXW3 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
SNHG12Q9BXW3 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
SNHG12Q9BXW3 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
SNHG12Q9BXW3 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
SNHG12Q9BXW3 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
SNHG12Q9BXW3 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
SNHG12Q9BXW3 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
SNHG12Q9BXW3 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
SNHG12Q9BXW3 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
SNHG12Q9BXW3 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
SNHG12Q9BXW3 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
SNHG12Q9BXW3 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
SNHG12Q9BXW3 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
SNHG12Q9BXW3 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
SNHG12Q9BXW3 EGR2-201ENST00000242480 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
SNHG12Q9BXW3 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
SNHG12Q9BXW3 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
SNHG12Q9BXW3 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
SNHG12Q9BXW3 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
SNHG12Q9BXW3 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC12.39□□□□□ -0.43
SNHG12Q9BXW3 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
SNHG12Q9BXW3 ELF4-201ENST00000308167 4165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
SNHG12Q9BXW3 ADAM12-201ENST00000368676 3313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
SNHG12Q9BXW3 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
SNHG12Q9BXW3 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
SNHG12Q9BXW3 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
SNHG12Q9BXW3 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
SNHG12Q9BXW3 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
SNHG12Q9BXW3 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
SNHG12Q9BXW3 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
SNHG12Q9BXW3 PROM2-203ENST00000403131 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
SNHG12Q9BXW3 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
SNHG12Q9BXW3 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
SNHG12Q9BXW3 AC005562.1-201ENST00000583030 3219 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
SNHG12Q9BXW3 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
SNHG12Q9BXW3 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
SNHG12Q9BXW3 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
SNHG12Q9BXW3 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
SNHG12Q9BXW3 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
SNHG12Q9BXW3 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
SNHG12Q9BXW3 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
SNHG12Q9BXW3 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
SNHG12Q9BXW3 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
SNHG12Q9BXW3 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
SNHG12Q9BXW3 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
SNHG12Q9BXW3 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
SNHG12Q9BXW3 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
SNHG12Q9BXW3 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
SNHG12Q9BXW3 RASGEF1A-202ENST00000374459 3264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
SNHG12Q9BXW3 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
SNHG12Q9BXW3 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
SNHG12Q9BXW3 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms