Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSI4

TINF2, TERF1-interacting nuclear factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TINF2Q9BSI4 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TINF2Q9BSI4 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TINF2Q9BSI4 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TINF2Q9BSI4 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TINF2Q9BSI4 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TINF2Q9BSI4 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
TINF2Q9BSI4 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
TINF2Q9BSI4 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TINF2Q9BSI4 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TINF2Q9BSI4 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TINF2Q9BSI4 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TINF2Q9BSI4 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TINF2Q9BSI4 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TINF2Q9BSI4 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TINF2Q9BSI4 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TINF2Q9BSI4 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TINF2Q9BSI4 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TINF2Q9BSI4 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TINF2Q9BSI4 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
TINF2Q9BSI4 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TINF2Q9BSI4 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
TINF2Q9BSI4 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TINF2Q9BSI4 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TINF2Q9BSI4 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
TINF2Q9BSI4 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TINF2Q9BSI4 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TINF2Q9BSI4 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TINF2Q9BSI4 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TINF2Q9BSI4 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TINF2Q9BSI4 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TINF2Q9BSI4 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
TINF2Q9BSI4 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TINF2Q9BSI4 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TINF2Q9BSI4 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TINF2Q9BSI4 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TINF2Q9BSI4 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TINF2Q9BSI4 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TINF2Q9BSI4 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TINF2Q9BSI4 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TINF2Q9BSI4 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TINF2Q9BSI4 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
TINF2Q9BSI4 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TINF2Q9BSI4 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TINF2Q9BSI4 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TINF2Q9BSI4 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TINF2Q9BSI4 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TINF2Q9BSI4 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TINF2Q9BSI4 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TINF2Q9BSI4 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TINF2Q9BSI4 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TINF2Q9BSI4 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TINF2Q9BSI4 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TINF2Q9BSI4 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TINF2Q9BSI4 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TINF2Q9BSI4 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TINF2Q9BSI4 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TINF2Q9BSI4 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TINF2Q9BSI4 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TINF2Q9BSI4 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TINF2Q9BSI4 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TINF2Q9BSI4 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TINF2Q9BSI4 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TINF2Q9BSI4 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TINF2Q9BSI4 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TINF2Q9BSI4 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TINF2Q9BSI4 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TINF2Q9BSI4 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
TINF2Q9BSI4 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TINF2Q9BSI4 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
TINF2Q9BSI4 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
TINF2Q9BSI4 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
TINF2Q9BSI4 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TINF2Q9BSI4 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TINF2Q9BSI4 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TINF2Q9BSI4 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TINF2Q9BSI4 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
TINF2Q9BSI4 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TINF2Q9BSI4 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TINF2Q9BSI4 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TINF2Q9BSI4 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TINF2Q9BSI4 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TINF2Q9BSI4 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TINF2Q9BSI4 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TINF2Q9BSI4 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TINF2Q9BSI4 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TINF2Q9BSI4 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TINF2Q9BSI4 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TINF2Q9BSI4 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TINF2Q9BSI4 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TINF2Q9BSI4 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TINF2Q9BSI4 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TINF2Q9BSI4 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TINF2Q9BSI4 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TINF2Q9BSI4 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TINF2Q9BSI4 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TINF2Q9BSI4 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TINF2Q9BSI4 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TINF2Q9BSI4 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TINF2Q9BSI4 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TINF2Q9BSI4 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms