Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQS8

FYCO1, FYVE and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FYCO1Q9BQS8 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
FYCO1Q9BQS8 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
FYCO1Q9BQS8 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
FYCO1Q9BQS8 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
FYCO1Q9BQS8 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
FYCO1Q9BQS8 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
FYCO1Q9BQS8 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
FYCO1Q9BQS8 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
FYCO1Q9BQS8 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
FYCO1Q9BQS8 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
FYCO1Q9BQS8 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
FYCO1Q9BQS8 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
FYCO1Q9BQS8 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
FYCO1Q9BQS8 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
FYCO1Q9BQS8 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
FYCO1Q9BQS8 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
FYCO1Q9BQS8 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
FYCO1Q9BQS8 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC26.52■■□□□ 1.84
FYCO1Q9BQS8 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
FYCO1Q9BQS8 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
FYCO1Q9BQS8 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
FYCO1Q9BQS8 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
FYCO1Q9BQS8 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
FYCO1Q9BQS8 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
FYCO1Q9BQS8 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
FYCO1Q9BQS8 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
FYCO1Q9BQS8 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
FYCO1Q9BQS8 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
FYCO1Q9BQS8 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
FYCO1Q9BQS8 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
FYCO1Q9BQS8 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
FYCO1Q9BQS8 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
FYCO1Q9BQS8 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
FYCO1Q9BQS8 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
FYCO1Q9BQS8 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
FYCO1Q9BQS8 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
FYCO1Q9BQS8 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
FYCO1Q9BQS8 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
FYCO1Q9BQS8 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
FYCO1Q9BQS8 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
FYCO1Q9BQS8 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
FYCO1Q9BQS8 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC26.5■■□□□ 1.83
FYCO1Q9BQS8 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
FYCO1Q9BQS8 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
FYCO1Q9BQS8 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC26.5■■□□□ 1.83
FYCO1Q9BQS8 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
FYCO1Q9BQS8 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
FYCO1Q9BQS8 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
FYCO1Q9BQS8 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
FYCO1Q9BQS8 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
FYCO1Q9BQS8 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
FYCO1Q9BQS8 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
FYCO1Q9BQS8 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
FYCO1Q9BQS8 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
FYCO1Q9BQS8 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
FYCO1Q9BQS8 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
FYCO1Q9BQS8 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
FYCO1Q9BQS8 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
FYCO1Q9BQS8 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
FYCO1Q9BQS8 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
FYCO1Q9BQS8 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
FYCO1Q9BQS8 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
FYCO1Q9BQS8 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
FYCO1Q9BQS8 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
FYCO1Q9BQS8 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
FYCO1Q9BQS8 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
FYCO1Q9BQS8 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
FYCO1Q9BQS8 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
FYCO1Q9BQS8 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
FYCO1Q9BQS8 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
FYCO1Q9BQS8 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
FYCO1Q9BQS8 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
FYCO1Q9BQS8 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
FYCO1Q9BQS8 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
FYCO1Q9BQS8 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
FYCO1Q9BQS8 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
FYCO1Q9BQS8 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
FYCO1Q9BQS8 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
FYCO1Q9BQS8 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
FYCO1Q9BQS8 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
FYCO1Q9BQS8 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
FYCO1Q9BQS8 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
FYCO1Q9BQS8 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
FYCO1Q9BQS8 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
FYCO1Q9BQS8 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
FYCO1Q9BQS8 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
FYCO1Q9BQS8 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC26.49■■□□□ 1.83
FYCO1Q9BQS8 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
FYCO1Q9BQS8 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
FYCO1Q9BQS8 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
FYCO1Q9BQS8 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
FYCO1Q9BQS8 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
FYCO1Q9BQS8 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
FYCO1Q9BQS8 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
FYCO1Q9BQS8 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
FYCO1Q9BQS8 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
FYCO1Q9BQS8 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
FYCO1Q9BQS8 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
FYCO1Q9BQS8 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
FYCO1Q9BQS8 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.9 ms