Protein–RNA interactions for Protein: Q96JN2

CCDC136, Coiled-coil domain-containing protein 136, humanhuman

Predictions only

Length 1,154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC136Q96JN2 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC136Q96JN2 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC136Q96JN2 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC136Q96JN2 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC136Q96JN2 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC136Q96JN2 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC136Q96JN2 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC136Q96JN2 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC136Q96JN2 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC136Q96JN2 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC136Q96JN2 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC136Q96JN2 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC136Q96JN2 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC136Q96JN2 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC136Q96JN2 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC136Q96JN2 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC136Q96JN2 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC136Q96JN2 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC136Q96JN2 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC136Q96JN2 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC136Q96JN2 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC136Q96JN2 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC136Q96JN2 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC136Q96JN2 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC136Q96JN2 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC136Q96JN2 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC136Q96JN2 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC136Q96JN2 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC136Q96JN2 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC136Q96JN2 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC136Q96JN2 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC136Q96JN2 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC136Q96JN2 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC136Q96JN2 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC136Q96JN2 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC136Q96JN2 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC136Q96JN2 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC136Q96JN2 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC136Q96JN2 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC136Q96JN2 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC136Q96JN2 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC136Q96JN2 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC136Q96JN2 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC136Q96JN2 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC136Q96JN2 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC136Q96JN2 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC136Q96JN2 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC136Q96JN2 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC136Q96JN2 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC136Q96JN2 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC136Q96JN2 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC136Q96JN2 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC136Q96JN2 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC136Q96JN2 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC136Q96JN2 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC136Q96JN2 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC136Q96JN2 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC136Q96JN2 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC136Q96JN2 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC136Q96JN2 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC136Q96JN2 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC136Q96JN2 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC136Q96JN2 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC136Q96JN2 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC136Q96JN2 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC136Q96JN2 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC136Q96JN2 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC136Q96JN2 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC136Q96JN2 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC136Q96JN2 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC136Q96JN2 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC136Q96JN2 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC136Q96JN2 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC136Q96JN2 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC136Q96JN2 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC136Q96JN2 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC136Q96JN2 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC136Q96JN2 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC136Q96JN2 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC136Q96JN2 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC136Q96JN2 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC136Q96JN2 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC136Q96JN2 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC136Q96JN2 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC136Q96JN2 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC136Q96JN2 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC136Q96JN2 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC136Q96JN2 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC136Q96JN2 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC136Q96JN2 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC136Q96JN2 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC136Q96JN2 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC136Q96JN2 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC136Q96JN2 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CCDC136Q96JN2 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.15
CCDC136Q96JN2 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
CCDC136Q96JN2 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC136Q96JN2 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC136Q96JN2 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC136Q96JN2 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.6 ms