Protein–RNA interactions for Protein: Q96DL1

NXPE2, NXPE family member 2, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NXPE2Q96DL1 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NXPE2Q96DL1 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NXPE2Q96DL1 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
NXPE2Q96DL1 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
NXPE2Q96DL1 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
NXPE2Q96DL1 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NXPE2Q96DL1 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NXPE2Q96DL1 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NXPE2Q96DL1 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NXPE2Q96DL1 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NXPE2Q96DL1 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NXPE2Q96DL1 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
NXPE2Q96DL1 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NXPE2Q96DL1 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
NXPE2Q96DL1 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
NXPE2Q96DL1 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NXPE2Q96DL1 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NXPE2Q96DL1 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NXPE2Q96DL1 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NXPE2Q96DL1 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NXPE2Q96DL1 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NXPE2Q96DL1 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NXPE2Q96DL1 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NXPE2Q96DL1 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NXPE2Q96DL1 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NXPE2Q96DL1 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NXPE2Q96DL1 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NXPE2Q96DL1 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
NXPE2Q96DL1 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NXPE2Q96DL1 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NXPE2Q96DL1 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NXPE2Q96DL1 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NXPE2Q96DL1 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NXPE2Q96DL1 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NXPE2Q96DL1 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NXPE2Q96DL1 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NXPE2Q96DL1 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NXPE2Q96DL1 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NXPE2Q96DL1 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NXPE2Q96DL1 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NXPE2Q96DL1 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NXPE2Q96DL1 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NXPE2Q96DL1 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NXPE2Q96DL1 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NXPE2Q96DL1 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NXPE2Q96DL1 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NXPE2Q96DL1 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NXPE2Q96DL1 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NXPE2Q96DL1 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NXPE2Q96DL1 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NXPE2Q96DL1 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NXPE2Q96DL1 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NXPE2Q96DL1 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NXPE2Q96DL1 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NXPE2Q96DL1 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NXPE2Q96DL1 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NXPE2Q96DL1 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NXPE2Q96DL1 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NXPE2Q96DL1 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NXPE2Q96DL1 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NXPE2Q96DL1 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NXPE2Q96DL1 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NXPE2Q96DL1 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NXPE2Q96DL1 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NXPE2Q96DL1 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NXPE2Q96DL1 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NXPE2Q96DL1 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NXPE2Q96DL1 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NXPE2Q96DL1 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NXPE2Q96DL1 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NXPE2Q96DL1 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NXPE2Q96DL1 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NXPE2Q96DL1 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NXPE2Q96DL1 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NXPE2Q96DL1 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NXPE2Q96DL1 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
NXPE2Q96DL1 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NXPE2Q96DL1 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NXPE2Q96DL1 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NXPE2Q96DL1 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NXPE2Q96DL1 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NXPE2Q96DL1 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NXPE2Q96DL1 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NXPE2Q96DL1 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NXPE2Q96DL1 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NXPE2Q96DL1 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NXPE2Q96DL1 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
NXPE2Q96DL1 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
NXPE2Q96DL1 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NXPE2Q96DL1 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NXPE2Q96DL1 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NXPE2Q96DL1 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NXPE2Q96DL1 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NXPE2Q96DL1 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NXPE2Q96DL1 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NXPE2Q96DL1 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NXPE2Q96DL1 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NXPE2Q96DL1 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NXPE2Q96DL1 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NXPE2Q96DL1 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms