Protein–RNA interactions for Protein: Q969G5

CAVIN3, Caveolae-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAVIN3Q969G5 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CAVIN3Q969G5 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CAVIN3Q969G5 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CAVIN3Q969G5 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CAVIN3Q969G5 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CAVIN3Q969G5 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CAVIN3Q969G5 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CAVIN3Q969G5 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CAVIN3Q969G5 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CAVIN3Q969G5 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CAVIN3Q969G5 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CAVIN3Q969G5 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CAVIN3Q969G5 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CAVIN3Q969G5 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CAVIN3Q969G5 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CAVIN3Q969G5 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CAVIN3Q969G5 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CAVIN3Q969G5 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CAVIN3Q969G5 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CAVIN3Q969G5 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CAVIN3Q969G5 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CAVIN3Q969G5 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CAVIN3Q969G5 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CAVIN3Q969G5 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CAVIN3Q969G5 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CAVIN3Q969G5 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CAVIN3Q969G5 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CAVIN3Q969G5 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CAVIN3Q969G5 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CAVIN3Q969G5 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CAVIN3Q969G5 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CAVIN3Q969G5 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CAVIN3Q969G5 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CAVIN3Q969G5 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CAVIN3Q969G5 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CAVIN3Q969G5 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CAVIN3Q969G5 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CAVIN3Q969G5 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CAVIN3Q969G5 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CAVIN3Q969G5 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CAVIN3Q969G5 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CAVIN3Q969G5 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CAVIN3Q969G5 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CAVIN3Q969G5 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CAVIN3Q969G5 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CAVIN3Q969G5 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CAVIN3Q969G5 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CAVIN3Q969G5 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CAVIN3Q969G5 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CAVIN3Q969G5 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CAVIN3Q969G5 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CAVIN3Q969G5 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CAVIN3Q969G5 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CAVIN3Q969G5 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CAVIN3Q969G5 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CAVIN3Q969G5 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CAVIN3Q969G5 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CAVIN3Q969G5 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CAVIN3Q969G5 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CAVIN3Q969G5 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CAVIN3Q969G5 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CAVIN3Q969G5 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CAVIN3Q969G5 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CAVIN3Q969G5 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CAVIN3Q969G5 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CAVIN3Q969G5 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CAVIN3Q969G5 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
CAVIN3Q969G5 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CAVIN3Q969G5 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CAVIN3Q969G5 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CAVIN3Q969G5 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CAVIN3Q969G5 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CAVIN3Q969G5 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CAVIN3Q969G5 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CAVIN3Q969G5 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
CAVIN3Q969G5 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CAVIN3Q969G5 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CAVIN3Q969G5 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CAVIN3Q969G5 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CAVIN3Q969G5 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CAVIN3Q969G5 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CAVIN3Q969G5 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CAVIN3Q969G5 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CAVIN3Q969G5 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
CAVIN3Q969G5 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CAVIN3Q969G5 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
CAVIN3Q969G5 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CAVIN3Q969G5 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CAVIN3Q969G5 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CAVIN3Q969G5 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CAVIN3Q969G5 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CAVIN3Q969G5 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CAVIN3Q969G5 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CAVIN3Q969G5 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CAVIN3Q969G5 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CAVIN3Q969G5 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CAVIN3Q969G5 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CAVIN3Q969G5 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CAVIN3Q969G5 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CAVIN3Q969G5 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms