Protein–RNA interactions for Protein: Q8WW22

DNAJA4, DnaJ homolog subfamily A member 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJA4Q8WW22 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
DNAJA4Q8WW22 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DNAJA4Q8WW22 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DNAJA4Q8WW22 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DNAJA4Q8WW22 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
DNAJA4Q8WW22 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
DNAJA4Q8WW22 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DNAJA4Q8WW22 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DNAJA4Q8WW22 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DNAJA4Q8WW22 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DNAJA4Q8WW22 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DNAJA4Q8WW22 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DNAJA4Q8WW22 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DNAJA4Q8WW22 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DNAJA4Q8WW22 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DNAJA4Q8WW22 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DNAJA4Q8WW22 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DNAJA4Q8WW22 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DNAJA4Q8WW22 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DNAJA4Q8WW22 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DNAJA4Q8WW22 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DNAJA4Q8WW22 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DNAJA4Q8WW22 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DNAJA4Q8WW22 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DNAJA4Q8WW22 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DNAJA4Q8WW22 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DNAJA4Q8WW22 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DNAJA4Q8WW22 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DNAJA4Q8WW22 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DNAJA4Q8WW22 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DNAJA4Q8WW22 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DNAJA4Q8WW22 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DNAJA4Q8WW22 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DNAJA4Q8WW22 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DNAJA4Q8WW22 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
DNAJA4Q8WW22 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DNAJA4Q8WW22 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DNAJA4Q8WW22 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DNAJA4Q8WW22 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DNAJA4Q8WW22 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DNAJA4Q8WW22 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DNAJA4Q8WW22 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DNAJA4Q8WW22 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
DNAJA4Q8WW22 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DNAJA4Q8WW22 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
DNAJA4Q8WW22 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DNAJA4Q8WW22 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DNAJA4Q8WW22 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
DNAJA4Q8WW22 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DNAJA4Q8WW22 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DNAJA4Q8WW22 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DNAJA4Q8WW22 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DNAJA4Q8WW22 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DNAJA4Q8WW22 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DNAJA4Q8WW22 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DNAJA4Q8WW22 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DNAJA4Q8WW22 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DNAJA4Q8WW22 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DNAJA4Q8WW22 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DNAJA4Q8WW22 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DNAJA4Q8WW22 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DNAJA4Q8WW22 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DNAJA4Q8WW22 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DNAJA4Q8WW22 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DNAJA4Q8WW22 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DNAJA4Q8WW22 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DNAJA4Q8WW22 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DNAJA4Q8WW22 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DNAJA4Q8WW22 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DNAJA4Q8WW22 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DNAJA4Q8WW22 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DNAJA4Q8WW22 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DNAJA4Q8WW22 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
DNAJA4Q8WW22 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DNAJA4Q8WW22 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DNAJA4Q8WW22 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DNAJA4Q8WW22 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
DNAJA4Q8WW22 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DNAJA4Q8WW22 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DNAJA4Q8WW22 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DNAJA4Q8WW22 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DNAJA4Q8WW22 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DNAJA4Q8WW22 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DNAJA4Q8WW22 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DNAJA4Q8WW22 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DNAJA4Q8WW22 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DNAJA4Q8WW22 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DNAJA4Q8WW22 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DNAJA4Q8WW22 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DNAJA4Q8WW22 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DNAJA4Q8WW22 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DNAJA4Q8WW22 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DNAJA4Q8WW22 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DNAJA4Q8WW22 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DNAJA4Q8WW22 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DNAJA4Q8WW22 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DNAJA4Q8WW22 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DNAJA4Q8WW22 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
DNAJA4Q8WW22 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
DNAJA4Q8WW22 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms