Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEW7

TMIE, Transmembrane inner ear expressed protein, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIEQ8NEW7 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TMIEQ8NEW7 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TMIEQ8NEW7 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TMIEQ8NEW7 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TMIEQ8NEW7 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TMIEQ8NEW7 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TMIEQ8NEW7 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TMIEQ8NEW7 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TMIEQ8NEW7 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
TMIEQ8NEW7 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
TMIEQ8NEW7 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
TMIEQ8NEW7 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TMIEQ8NEW7 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TMIEQ8NEW7 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TMIEQ8NEW7 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TMIEQ8NEW7 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TMIEQ8NEW7 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TMIEQ8NEW7 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TMIEQ8NEW7 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TMIEQ8NEW7 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TMIEQ8NEW7 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TMIEQ8NEW7 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TMIEQ8NEW7 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TMIEQ8NEW7 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TMIEQ8NEW7 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TMIEQ8NEW7 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TMIEQ8NEW7 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TMIEQ8NEW7 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TMIEQ8NEW7 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TMIEQ8NEW7 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TMIEQ8NEW7 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TMIEQ8NEW7 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TMIEQ8NEW7 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TMIEQ8NEW7 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TMIEQ8NEW7 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TMIEQ8NEW7 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TMIEQ8NEW7 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TMIEQ8NEW7 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TMIEQ8NEW7 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TMIEQ8NEW7 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TMIEQ8NEW7 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TMIEQ8NEW7 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TMIEQ8NEW7 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TMIEQ8NEW7 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TMIEQ8NEW7 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TMIEQ8NEW7 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TMIEQ8NEW7 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TMIEQ8NEW7 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TMIEQ8NEW7 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
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TMIEQ8NEW7 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
TMIEQ8NEW7 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TMIEQ8NEW7 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TMIEQ8NEW7 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TMIEQ8NEW7 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TMIEQ8NEW7 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TMIEQ8NEW7 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TMIEQ8NEW7 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TMIEQ8NEW7 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TMIEQ8NEW7 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TMIEQ8NEW7 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TMIEQ8NEW7 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
TMIEQ8NEW7 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
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TMIEQ8NEW7 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TMIEQ8NEW7 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TMIEQ8NEW7 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TMIEQ8NEW7 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TMIEQ8NEW7 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TMIEQ8NEW7 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TMIEQ8NEW7 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TMIEQ8NEW7 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TMIEQ8NEW7 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TMIEQ8NEW7 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TMIEQ8NEW7 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TMIEQ8NEW7 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TMIEQ8NEW7 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TMIEQ8NEW7 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TMIEQ8NEW7 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TMIEQ8NEW7 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TMIEQ8NEW7 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TMIEQ8NEW7 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
TMIEQ8NEW7 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TMIEQ8NEW7 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
TMIEQ8NEW7 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TMIEQ8NEW7 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TMIEQ8NEW7 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
TMIEQ8NEW7 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TMIEQ8NEW7 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TMIEQ8NEW7 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TMIEQ8NEW7 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TMIEQ8NEW7 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TMIEQ8NEW7 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TMIEQ8NEW7 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TMIEQ8NEW7 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TMIEQ8NEW7 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TMIEQ8NEW7 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TMIEQ8NEW7 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TMIEQ8NEW7 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms