Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCD3

HJURP, Holliday junction recognition protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HJURPQ8NCD3 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HJURPQ8NCD3 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
HJURPQ8NCD3 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HJURPQ8NCD3 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HJURPQ8NCD3 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HJURPQ8NCD3 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HJURPQ8NCD3 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HJURPQ8NCD3 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HJURPQ8NCD3 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HJURPQ8NCD3 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HJURPQ8NCD3 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HJURPQ8NCD3 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HJURPQ8NCD3 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HJURPQ8NCD3 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HJURPQ8NCD3 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HJURPQ8NCD3 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HJURPQ8NCD3 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HJURPQ8NCD3 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HJURPQ8NCD3 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HJURPQ8NCD3 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HJURPQ8NCD3 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HJURPQ8NCD3 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HJURPQ8NCD3 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HJURPQ8NCD3 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HJURPQ8NCD3 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HJURPQ8NCD3 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HJURPQ8NCD3 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HJURPQ8NCD3 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HJURPQ8NCD3 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HJURPQ8NCD3 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HJURPQ8NCD3 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HJURPQ8NCD3 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HJURPQ8NCD3 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HJURPQ8NCD3 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HJURPQ8NCD3 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HJURPQ8NCD3 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HJURPQ8NCD3 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HJURPQ8NCD3 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
HJURPQ8NCD3 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
HJURPQ8NCD3 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
HJURPQ8NCD3 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HJURPQ8NCD3 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
HJURPQ8NCD3 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
HJURPQ8NCD3 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HJURPQ8NCD3 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
HJURPQ8NCD3 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
HJURPQ8NCD3 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HJURPQ8NCD3 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
HJURPQ8NCD3 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
HJURPQ8NCD3 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HJURPQ8NCD3 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
HJURPQ8NCD3 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
HJURPQ8NCD3 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
HJURPQ8NCD3 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
HJURPQ8NCD3 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
HJURPQ8NCD3 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC17.66■□□□□ 0.42
HJURPQ8NCD3 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
HJURPQ8NCD3 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HJURPQ8NCD3 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HJURPQ8NCD3 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
HJURPQ8NCD3 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HJURPQ8NCD3 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HJURPQ8NCD3 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HJURPQ8NCD3 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HJURPQ8NCD3 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HJURPQ8NCD3 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HJURPQ8NCD3 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HJURPQ8NCD3 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HJURPQ8NCD3 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
HJURPQ8NCD3 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
HJURPQ8NCD3 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
HJURPQ8NCD3 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
HJURPQ8NCD3 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
HJURPQ8NCD3 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
HJURPQ8NCD3 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
HJURPQ8NCD3 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
HJURPQ8NCD3 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
HJURPQ8NCD3 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
HJURPQ8NCD3 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
HJURPQ8NCD3 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
HJURPQ8NCD3 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
HJURPQ8NCD3 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
HJURPQ8NCD3 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
HJURPQ8NCD3 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
HJURPQ8NCD3 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
HJURPQ8NCD3 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
HJURPQ8NCD3 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
HJURPQ8NCD3 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
HJURPQ8NCD3 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
HJURPQ8NCD3 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
HJURPQ8NCD3 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
HJURPQ8NCD3 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
HJURPQ8NCD3 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
HJURPQ8NCD3 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
HJURPQ8NCD3 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
HJURPQ8NCD3 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
HJURPQ8NCD3 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
HJURPQ8NCD3 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
HJURPQ8NCD3 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
HJURPQ8NCD3 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms