Protein–RNA interactions for Protein: Q6P4E1

CASC4, Protein CASC4, humanhuman

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASC4Q6P4E1 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CASC4Q6P4E1 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CASC4Q6P4E1 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CASC4Q6P4E1 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CASC4Q6P4E1 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CASC4Q6P4E1 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CASC4Q6P4E1 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CASC4Q6P4E1 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
CASC4Q6P4E1 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CASC4Q6P4E1 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CASC4Q6P4E1 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CASC4Q6P4E1 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CASC4Q6P4E1 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CASC4Q6P4E1 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CASC4Q6P4E1 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CASC4Q6P4E1 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CASC4Q6P4E1 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CASC4Q6P4E1 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CASC4Q6P4E1 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CASC4Q6P4E1 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CASC4Q6P4E1 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CASC4Q6P4E1 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CASC4Q6P4E1 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CASC4Q6P4E1 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CASC4Q6P4E1 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CASC4Q6P4E1 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CASC4Q6P4E1 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CASC4Q6P4E1 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CASC4Q6P4E1 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CASC4Q6P4E1 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CASC4Q6P4E1 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CASC4Q6P4E1 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CASC4Q6P4E1 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CASC4Q6P4E1 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CASC4Q6P4E1 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CASC4Q6P4E1 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CASC4Q6P4E1 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CASC4Q6P4E1 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
CASC4Q6P4E1 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CASC4Q6P4E1 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CASC4Q6P4E1 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CASC4Q6P4E1 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CASC4Q6P4E1 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CASC4Q6P4E1 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CASC4Q6P4E1 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
CASC4Q6P4E1 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CASC4Q6P4E1 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CASC4Q6P4E1 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CASC4Q6P4E1 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CASC4Q6P4E1 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CASC4Q6P4E1 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CASC4Q6P4E1 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CASC4Q6P4E1 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CASC4Q6P4E1 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CASC4Q6P4E1 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CASC4Q6P4E1 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CASC4Q6P4E1 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CASC4Q6P4E1 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CASC4Q6P4E1 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CASC4Q6P4E1 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CASC4Q6P4E1 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CASC4Q6P4E1 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CASC4Q6P4E1 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
CASC4Q6P4E1 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CASC4Q6P4E1 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CASC4Q6P4E1 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CASC4Q6P4E1 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CASC4Q6P4E1 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CASC4Q6P4E1 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CASC4Q6P4E1 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CASC4Q6P4E1 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CASC4Q6P4E1 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CASC4Q6P4E1 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CASC4Q6P4E1 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CASC4Q6P4E1 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CASC4Q6P4E1 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CASC4Q6P4E1 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CASC4Q6P4E1 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CASC4Q6P4E1 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CASC4Q6P4E1 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CASC4Q6P4E1 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CASC4Q6P4E1 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
CASC4Q6P4E1 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
CASC4Q6P4E1 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CASC4Q6P4E1 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CASC4Q6P4E1 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CASC4Q6P4E1 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CASC4Q6P4E1 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CASC4Q6P4E1 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CASC4Q6P4E1 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CASC4Q6P4E1 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CASC4Q6P4E1 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CASC4Q6P4E1 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CASC4Q6P4E1 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CASC4Q6P4E1 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CASC4Q6P4E1 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CASC4Q6P4E1 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CASC4Q6P4E1 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CASC4Q6P4E1 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CASC4Q6P4E1 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54 ms