Protein–RNA interactions for Protein: Q5XUX1

FBXW9, F-box/WD repeat-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 488 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXW9Q5XUX1 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FBXW9Q5XUX1 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FBXW9Q5XUX1 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FBXW9Q5XUX1 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FBXW9Q5XUX1 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FBXW9Q5XUX1 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FBXW9Q5XUX1 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
FBXW9Q5XUX1 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FBXW9Q5XUX1 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
FBXW9Q5XUX1 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FBXW9Q5XUX1 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FBXW9Q5XUX1 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FBXW9Q5XUX1 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FBXW9Q5XUX1 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FBXW9Q5XUX1 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
FBXW9Q5XUX1 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FBXW9Q5XUX1 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FBXW9Q5XUX1 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FBXW9Q5XUX1 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FBXW9Q5XUX1 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FBXW9Q5XUX1 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FBXW9Q5XUX1 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FBXW9Q5XUX1 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FBXW9Q5XUX1 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FBXW9Q5XUX1 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FBXW9Q5XUX1 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FBXW9Q5XUX1 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FBXW9Q5XUX1 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FBXW9Q5XUX1 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FBXW9Q5XUX1 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FBXW9Q5XUX1 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FBXW9Q5XUX1 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FBXW9Q5XUX1 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FBXW9Q5XUX1 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FBXW9Q5XUX1 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FBXW9Q5XUX1 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FBXW9Q5XUX1 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FBXW9Q5XUX1 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FBXW9Q5XUX1 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FBXW9Q5XUX1 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FBXW9Q5XUX1 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FBXW9Q5XUX1 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FBXW9Q5XUX1 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FBXW9Q5XUX1 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FBXW9Q5XUX1 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
FBXW9Q5XUX1 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FBXW9Q5XUX1 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FBXW9Q5XUX1 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FBXW9Q5XUX1 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
FBXW9Q5XUX1 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FBXW9Q5XUX1 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FBXW9Q5XUX1 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FBXW9Q5XUX1 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FBXW9Q5XUX1 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FBXW9Q5XUX1 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FBXW9Q5XUX1 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FBXW9Q5XUX1 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FBXW9Q5XUX1 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
FBXW9Q5XUX1 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
FBXW9Q5XUX1 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
FBXW9Q5XUX1 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
FBXW9Q5XUX1 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
FBXW9Q5XUX1 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
FBXW9Q5XUX1 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
FBXW9Q5XUX1 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FBXW9Q5XUX1 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FBXW9Q5XUX1 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FBXW9Q5XUX1 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FBXW9Q5XUX1 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
FBXW9Q5XUX1 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FBXW9Q5XUX1 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FBXW9Q5XUX1 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FBXW9Q5XUX1 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FBXW9Q5XUX1 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FBXW9Q5XUX1 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FBXW9Q5XUX1 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FBXW9Q5XUX1 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FBXW9Q5XUX1 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FBXW9Q5XUX1 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FBXW9Q5XUX1 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FBXW9Q5XUX1 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FBXW9Q5XUX1 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FBXW9Q5XUX1 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FBXW9Q5XUX1 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FBXW9Q5XUX1 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FBXW9Q5XUX1 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FBXW9Q5XUX1 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FBXW9Q5XUX1 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FBXW9Q5XUX1 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
FBXW9Q5XUX1 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
FBXW9Q5XUX1 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FBXW9Q5XUX1 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FBXW9Q5XUX1 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FBXW9Q5XUX1 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FBXW9Q5XUX1 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FBXW9Q5XUX1 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
FBXW9Q5XUX1 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FBXW9Q5XUX1 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FBXW9Q5XUX1 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FBXW9Q5XUX1 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms