Protein–RNA interactions for Protein: Q53GT1

KLHL22, Kelch-like protein 22, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL22Q53GT1 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLHL22Q53GT1 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLHL22Q53GT1 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
KLHL22Q53GT1 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLHL22Q53GT1 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLHL22Q53GT1 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLHL22Q53GT1 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLHL22Q53GT1 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLHL22Q53GT1 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLHL22Q53GT1 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLHL22Q53GT1 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLHL22Q53GT1 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLHL22Q53GT1 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLHL22Q53GT1 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLHL22Q53GT1 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLHL22Q53GT1 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLHL22Q53GT1 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLHL22Q53GT1 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLHL22Q53GT1 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLHL22Q53GT1 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLHL22Q53GT1 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLHL22Q53GT1 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLHL22Q53GT1 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLHL22Q53GT1 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLHL22Q53GT1 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLHL22Q53GT1 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLHL22Q53GT1 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLHL22Q53GT1 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLHL22Q53GT1 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLHL22Q53GT1 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLHL22Q53GT1 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLHL22Q53GT1 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLHL22Q53GT1 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLHL22Q53GT1 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLHL22Q53GT1 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLHL22Q53GT1 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLHL22Q53GT1 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLHL22Q53GT1 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
KLHL22Q53GT1 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLHL22Q53GT1 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLHL22Q53GT1 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLHL22Q53GT1 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLHL22Q53GT1 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLHL22Q53GT1 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLHL22Q53GT1 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLHL22Q53GT1 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLHL22Q53GT1 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLHL22Q53GT1 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLHL22Q53GT1 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLHL22Q53GT1 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLHL22Q53GT1 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
KLHL22Q53GT1 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLHL22Q53GT1 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLHL22Q53GT1 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLHL22Q53GT1 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLHL22Q53GT1 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLHL22Q53GT1 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLHL22Q53GT1 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLHL22Q53GT1 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLHL22Q53GT1 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLHL22Q53GT1 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLHL22Q53GT1 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLHL22Q53GT1 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLHL22Q53GT1 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLHL22Q53GT1 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLHL22Q53GT1 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLHL22Q53GT1 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLHL22Q53GT1 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
KLHL22Q53GT1 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLHL22Q53GT1 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLHL22Q53GT1 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLHL22Q53GT1 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLHL22Q53GT1 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLHL22Q53GT1 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLHL22Q53GT1 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
KLHL22Q53GT1 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLHL22Q53GT1 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLHL22Q53GT1 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLHL22Q53GT1 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLHL22Q53GT1 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
KLHL22Q53GT1 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLHL22Q53GT1 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLHL22Q53GT1 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLHL22Q53GT1 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLHL22Q53GT1 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLHL22Q53GT1 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLHL22Q53GT1 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLHL22Q53GT1 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLHL22Q53GT1 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLHL22Q53GT1 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLHL22Q53GT1 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLHL22Q53GT1 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLHL22Q53GT1 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
KLHL22Q53GT1 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLHL22Q53GT1 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLHL22Q53GT1 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLHL22Q53GT1 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLHL22Q53GT1 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLHL22Q53GT1 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLHL22Q53GT1 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms