Protein–RNA interactions for Protein: Q4G0W2

DUSP28, Dual specificity phosphatase 28, humanhuman

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP28Q4G0W2 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
DUSP28Q4G0W2 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
DUSP28Q4G0W2 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
DUSP28Q4G0W2 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
DUSP28Q4G0W2 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
DUSP28Q4G0W2 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
DUSP28Q4G0W2 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
DUSP28Q4G0W2 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.65
DUSP28Q4G0W2 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
DUSP28Q4G0W2 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
DUSP28Q4G0W2 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
DUSP28Q4G0W2 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
DUSP28Q4G0W2 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
DUSP28Q4G0W2 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
DUSP28Q4G0W2 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
DUSP28Q4G0W2 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
DUSP28Q4G0W2 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
DUSP28Q4G0W2 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
DUSP28Q4G0W2 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
DUSP28Q4G0W2 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
DUSP28Q4G0W2 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
DUSP28Q4G0W2 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
DUSP28Q4G0W2 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
DUSP28Q4G0W2 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
DUSP28Q4G0W2 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
DUSP28Q4G0W2 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
DUSP28Q4G0W2 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
DUSP28Q4G0W2 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
DUSP28Q4G0W2 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
DUSP28Q4G0W2 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
DUSP28Q4G0W2 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
DUSP28Q4G0W2 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
DUSP28Q4G0W2 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
DUSP28Q4G0W2 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
DUSP28Q4G0W2 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
DUSP28Q4G0W2 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
DUSP28Q4G0W2 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
DUSP28Q4G0W2 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
DUSP28Q4G0W2 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
DUSP28Q4G0W2 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
DUSP28Q4G0W2 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
DUSP28Q4G0W2 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
DUSP28Q4G0W2 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
DUSP28Q4G0W2 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
DUSP28Q4G0W2 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
DUSP28Q4G0W2 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
DUSP28Q4G0W2 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
DUSP28Q4G0W2 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
DUSP28Q4G0W2 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
DUSP28Q4G0W2 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
DUSP28Q4G0W2 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
DUSP28Q4G0W2 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
DUSP28Q4G0W2 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
DUSP28Q4G0W2 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
DUSP28Q4G0W2 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
DUSP28Q4G0W2 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
DUSP28Q4G0W2 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
DUSP28Q4G0W2 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
DUSP28Q4G0W2 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
DUSP28Q4G0W2 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
DUSP28Q4G0W2 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
DUSP28Q4G0W2 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
DUSP28Q4G0W2 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
DUSP28Q4G0W2 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
DUSP28Q4G0W2 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
DUSP28Q4G0W2 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
DUSP28Q4G0W2 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
DUSP28Q4G0W2 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
DUSP28Q4G0W2 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
DUSP28Q4G0W2 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
DUSP28Q4G0W2 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
DUSP28Q4G0W2 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
DUSP28Q4G0W2 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
DUSP28Q4G0W2 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
DUSP28Q4G0W2 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
DUSP28Q4G0W2 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
DUSP28Q4G0W2 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
DUSP28Q4G0W2 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
DUSP28Q4G0W2 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
DUSP28Q4G0W2 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
DUSP28Q4G0W2 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
DUSP28Q4G0W2 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
DUSP28Q4G0W2 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
DUSP28Q4G0W2 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
DUSP28Q4G0W2 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
DUSP28Q4G0W2 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
DUSP28Q4G0W2 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
DUSP28Q4G0W2 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
DUSP28Q4G0W2 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
DUSP28Q4G0W2 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
DUSP28Q4G0W2 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
DUSP28Q4G0W2 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
DUSP28Q4G0W2 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
DUSP28Q4G0W2 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
DUSP28Q4G0W2 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
DUSP28Q4G0W2 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
DUSP28Q4G0W2 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
DUSP28Q4G0W2 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
DUSP28Q4G0W2 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
DUSP28Q4G0W2 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms