Protein–RNA interactions for Protein: Q2TBA0

KLHL40, Kelch-like protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL40Q2TBA0 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
KLHL40Q2TBA0 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
KLHL40Q2TBA0 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
KLHL40Q2TBA0 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
KLHL40Q2TBA0 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
KLHL40Q2TBA0 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
KLHL40Q2TBA0 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
KLHL40Q2TBA0 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
KLHL40Q2TBA0 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
KLHL40Q2TBA0 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
KLHL40Q2TBA0 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
KLHL40Q2TBA0 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
KLHL40Q2TBA0 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
KLHL40Q2TBA0 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
KLHL40Q2TBA0 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
KLHL40Q2TBA0 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
KLHL40Q2TBA0 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
KLHL40Q2TBA0 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
KLHL40Q2TBA0 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
KLHL40Q2TBA0 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
KLHL40Q2TBA0 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
KLHL40Q2TBA0 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
KLHL40Q2TBA0 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
KLHL40Q2TBA0 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
KLHL40Q2TBA0 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
KLHL40Q2TBA0 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
KLHL40Q2TBA0 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
KLHL40Q2TBA0 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
KLHL40Q2TBA0 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
KLHL40Q2TBA0 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
KLHL40Q2TBA0 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
KLHL40Q2TBA0 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
KLHL40Q2TBA0 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
KLHL40Q2TBA0 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
KLHL40Q2TBA0 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
KLHL40Q2TBA0 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
KLHL40Q2TBA0 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
KLHL40Q2TBA0 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
KLHL40Q2TBA0 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
KLHL40Q2TBA0 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
KLHL40Q2TBA0 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
KLHL40Q2TBA0 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
KLHL40Q2TBA0 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
KLHL40Q2TBA0 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
KLHL40Q2TBA0 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
KLHL40Q2TBA0 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
KLHL40Q2TBA0 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
KLHL40Q2TBA0 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
KLHL40Q2TBA0 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
KLHL40Q2TBA0 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
KLHL40Q2TBA0 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
KLHL40Q2TBA0 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
KLHL40Q2TBA0 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
KLHL40Q2TBA0 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
KLHL40Q2TBA0 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
KLHL40Q2TBA0 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
KLHL40Q2TBA0 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
KLHL40Q2TBA0 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
KLHL40Q2TBA0 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
KLHL40Q2TBA0 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
KLHL40Q2TBA0 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
KLHL40Q2TBA0 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
KLHL40Q2TBA0 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
KLHL40Q2TBA0 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
KLHL40Q2TBA0 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
KLHL40Q2TBA0 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
KLHL40Q2TBA0 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
KLHL40Q2TBA0 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
KLHL40Q2TBA0 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
KLHL40Q2TBA0 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
KLHL40Q2TBA0 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
KLHL40Q2TBA0 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
KLHL40Q2TBA0 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
KLHL40Q2TBA0 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
KLHL40Q2TBA0 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
KLHL40Q2TBA0 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
KLHL40Q2TBA0 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
KLHL40Q2TBA0 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
KLHL40Q2TBA0 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
KLHL40Q2TBA0 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
KLHL40Q2TBA0 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
KLHL40Q2TBA0 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
KLHL40Q2TBA0 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
KLHL40Q2TBA0 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
KLHL40Q2TBA0 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
KLHL40Q2TBA0 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
KLHL40Q2TBA0 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
KLHL40Q2TBA0 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
KLHL40Q2TBA0 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
KLHL40Q2TBA0 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
KLHL40Q2TBA0 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
KLHL40Q2TBA0 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
KLHL40Q2TBA0 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
KLHL40Q2TBA0 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
KLHL40Q2TBA0 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
KLHL40Q2TBA0 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
KLHL40Q2TBA0 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
KLHL40Q2TBA0 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
KLHL40Q2TBA0 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
KLHL40Q2TBA0 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms