Protein–RNA interactions for Protein: Q16878

CDO1, Cysteine dioxygenase type 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDO1Q16878 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CDO1Q16878 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CDO1Q16878 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CDO1Q16878 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CDO1Q16878 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CDO1Q16878 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CDO1Q16878 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CDO1Q16878 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CDO1Q16878 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CDO1Q16878 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CDO1Q16878 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CDO1Q16878 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CDO1Q16878 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CDO1Q16878 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CDO1Q16878 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CDO1Q16878 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CDO1Q16878 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CDO1Q16878 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CDO1Q16878 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CDO1Q16878 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CDO1Q16878 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CDO1Q16878 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CDO1Q16878 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CDO1Q16878 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CDO1Q16878 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CDO1Q16878 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CDO1Q16878 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CDO1Q16878 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CDO1Q16878 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CDO1Q16878 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CDO1Q16878 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CDO1Q16878 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CDO1Q16878 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CDO1Q16878 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CDO1Q16878 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CDO1Q16878 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CDO1Q16878 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CDO1Q16878 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CDO1Q16878 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CDO1Q16878 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CDO1Q16878 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CDO1Q16878 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CDO1Q16878 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CDO1Q16878 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CDO1Q16878 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CDO1Q16878 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CDO1Q16878 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CDO1Q16878 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CDO1Q16878 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CDO1Q16878 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CDO1Q16878 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CDO1Q16878 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CDO1Q16878 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CDO1Q16878 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CDO1Q16878 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CDO1Q16878 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CDO1Q16878 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CDO1Q16878 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CDO1Q16878 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CDO1Q16878 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CDO1Q16878 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CDO1Q16878 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CDO1Q16878 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CDO1Q16878 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CDO1Q16878 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CDO1Q16878 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CDO1Q16878 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CDO1Q16878 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CDO1Q16878 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CDO1Q16878 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CDO1Q16878 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CDO1Q16878 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CDO1Q16878 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CDO1Q16878 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CDO1Q16878 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CDO1Q16878 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CDO1Q16878 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CDO1Q16878 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CDO1Q16878 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CDO1Q16878 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CDO1Q16878 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CDO1Q16878 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CDO1Q16878 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CDO1Q16878 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CDO1Q16878 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CDO1Q16878 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CDO1Q16878 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CDO1Q16878 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CDO1Q16878 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CDO1Q16878 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CDO1Q16878 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CDO1Q16878 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CDO1Q16878 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CDO1Q16878 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CDO1Q16878 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
CDO1Q16878 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CDO1Q16878 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
CDO1Q16878 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
CDO1Q16878 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CDO1Q16878 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
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