Protein–RNA interactions for Protein: Q16827

PTPRO, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase O, humanhuman

Predictions only

Length 1,216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPROQ16827 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTPROQ16827 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTPROQ16827 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTPROQ16827 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTPROQ16827 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
PTPROQ16827 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTPROQ16827 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTPROQ16827 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTPROQ16827 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTPROQ16827 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
PTPROQ16827 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTPROQ16827 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTPROQ16827 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTPROQ16827 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTPROQ16827 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTPROQ16827 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTPROQ16827 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTPROQ16827 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTPROQ16827 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTPROQ16827 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTPROQ16827 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTPROQ16827 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTPROQ16827 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTPROQ16827 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTPROQ16827 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTPROQ16827 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
PTPROQ16827 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTPROQ16827 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTPROQ16827 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTPROQ16827 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
PTPROQ16827 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTPROQ16827 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTPROQ16827 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTPROQ16827 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTPROQ16827 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTPROQ16827 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTPROQ16827 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTPROQ16827 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTPROQ16827 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTPROQ16827 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTPROQ16827 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTPROQ16827 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTPROQ16827 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTPROQ16827 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTPROQ16827 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
PTPROQ16827 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTPROQ16827 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTPROQ16827 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTPROQ16827 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTPROQ16827 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTPROQ16827 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTPROQ16827 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTPROQ16827 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTPROQ16827 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTPROQ16827 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTPROQ16827 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTPROQ16827 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTPROQ16827 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTPROQ16827 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTPROQ16827 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTPROQ16827 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
PTPROQ16827 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTPROQ16827 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTPROQ16827 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTPROQ16827 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTPROQ16827 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
PTPROQ16827 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTPROQ16827 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTPROQ16827 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTPROQ16827 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
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PTPROQ16827 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTPROQ16827 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTPROQ16827 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTPROQ16827 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTPROQ16827 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTPROQ16827 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTPROQ16827 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
PTPROQ16827 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTPROQ16827 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTPROQ16827 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTPROQ16827 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTPROQ16827 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTPROQ16827 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
PTPROQ16827 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTPROQ16827 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTPROQ16827 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTPROQ16827 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTPROQ16827 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTPROQ16827 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTPROQ16827 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTPROQ16827 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTPROQ16827 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTPROQ16827 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTPROQ16827 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTPROQ16827 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTPROQ16827 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTPROQ16827 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTPROQ16827 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTPROQ16827 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
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