Protein–RNA interactions for Protein: Q16656

NRF1, Nuclear respiratory factor 1, humanhuman

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Length 503 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRF1Q16656 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NRF1Q16656 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NRF1Q16656 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NRF1Q16656 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NRF1Q16656 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NRF1Q16656 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NRF1Q16656 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NRF1Q16656 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NRF1Q16656 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NRF1Q16656 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NRF1Q16656 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NRF1Q16656 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NRF1Q16656 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
NRF1Q16656 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NRF1Q16656 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NRF1Q16656 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NRF1Q16656 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NRF1Q16656 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NRF1Q16656 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NRF1Q16656 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NRF1Q16656 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NRF1Q16656 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NRF1Q16656 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NRF1Q16656 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NRF1Q16656 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NRF1Q16656 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NRF1Q16656 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NRF1Q16656 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NRF1Q16656 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NRF1Q16656 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NRF1Q16656 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NRF1Q16656 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NRF1Q16656 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NRF1Q16656 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
NRF1Q16656 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NRF1Q16656 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
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NRF1Q16656 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NRF1Q16656 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NRF1Q16656 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
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NRF1Q16656 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
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NRF1Q16656 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NRF1Q16656 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NRF1Q16656 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NRF1Q16656 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
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NRF1Q16656 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NRF1Q16656 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NRF1Q16656 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NRF1Q16656 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NRF1Q16656 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
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NRF1Q16656 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NRF1Q16656 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NRF1Q16656 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
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NRF1Q16656 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
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NRF1Q16656 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
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NRF1Q16656 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
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NRF1Q16656 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NRF1Q16656 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NRF1Q16656 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NRF1Q16656 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NRF1Q16656 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NRF1Q16656 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NRF1Q16656 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NRF1Q16656 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NRF1Q16656 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NRF1Q16656 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NRF1Q16656 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NRF1Q16656 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NRF1Q16656 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NRF1Q16656 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NRF1Q16656 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NRF1Q16656 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms