Protein–RNA interactions for Protein: Q16600

ZNF239, Zinc finger protein 239, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF239Q16600 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF239Q16600 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF239Q16600 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF239Q16600 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF239Q16600 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF239Q16600 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF239Q16600 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF239Q16600 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF239Q16600 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF239Q16600 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF239Q16600 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF239Q16600 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF239Q16600 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF239Q16600 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF239Q16600 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF239Q16600 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF239Q16600 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF239Q16600 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF239Q16600 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF239Q16600 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF239Q16600 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF239Q16600 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ZNF239Q16600 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ZNF239Q16600 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ZNF239Q16600 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ZNF239Q16600 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ZNF239Q16600 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ZNF239Q16600 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ZNF239Q16600 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
ZNF239Q16600 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ZNF239Q16600 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ZNF239Q16600 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ZNF239Q16600 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF239Q16600 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF239Q16600 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF239Q16600 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF239Q16600 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF239Q16600 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF239Q16600 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF239Q16600 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF239Q16600 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF239Q16600 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF239Q16600 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF239Q16600 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF239Q16600 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF239Q16600 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF239Q16600 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF239Q16600 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF239Q16600 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF239Q16600 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF239Q16600 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF239Q16600 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF239Q16600 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF239Q16600 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF239Q16600 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF239Q16600 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF239Q16600 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF239Q16600 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF239Q16600 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF239Q16600 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF239Q16600 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF239Q16600 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF239Q16600 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF239Q16600 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF239Q16600 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF239Q16600 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF239Q16600 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF239Q16600 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF239Q16600 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF239Q16600 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF239Q16600 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF239Q16600 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF239Q16600 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF239Q16600 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF239Q16600 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF239Q16600 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF239Q16600 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF239Q16600 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF239Q16600 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF239Q16600 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF239Q16600 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF239Q16600 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF239Q16600 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF239Q16600 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF239Q16600 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF239Q16600 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF239Q16600 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF239Q16600 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF239Q16600 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF239Q16600 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF239Q16600 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF239Q16600 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF239Q16600 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF239Q16600 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF239Q16600 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF239Q16600 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF239Q16600 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF239Q16600 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF239Q16600 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF239Q16600 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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