Protein–RNA interactions for Protein: Q15843

NEDD8, NEDD8, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8Q15843 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NEDD8Q15843 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NEDD8Q15843 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NEDD8Q15843 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NEDD8Q15843 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NEDD8Q15843 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NEDD8Q15843 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NEDD8Q15843 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NEDD8Q15843 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NEDD8Q15843 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NEDD8Q15843 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NEDD8Q15843 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
NEDD8Q15843 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NEDD8Q15843 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NEDD8Q15843 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NEDD8Q15843 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NEDD8Q15843 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NEDD8Q15843 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NEDD8Q15843 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NEDD8Q15843 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NEDD8Q15843 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NEDD8Q15843 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NEDD8Q15843 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NEDD8Q15843 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NEDD8Q15843 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NEDD8Q15843 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
NEDD8Q15843 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
NEDD8Q15843 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
NEDD8Q15843 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NEDD8Q15843 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NEDD8Q15843 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NEDD8Q15843 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NEDD8Q15843 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NEDD8Q15843 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NEDD8Q15843 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NEDD8Q15843 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NEDD8Q15843 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NEDD8Q15843 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NEDD8Q15843 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NEDD8Q15843 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NEDD8Q15843 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NEDD8Q15843 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NEDD8Q15843 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NEDD8Q15843 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NEDD8Q15843 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NEDD8Q15843 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NEDD8Q15843 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NEDD8Q15843 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
NEDD8Q15843 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NEDD8Q15843 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NEDD8Q15843 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NEDD8Q15843 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NEDD8Q15843 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NEDD8Q15843 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NEDD8Q15843 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NEDD8Q15843 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NEDD8Q15843 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
NEDD8Q15843 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NEDD8Q15843 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NEDD8Q15843 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
NEDD8Q15843 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NEDD8Q15843 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NEDD8Q15843 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NEDD8Q15843 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NEDD8Q15843 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NEDD8Q15843 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NEDD8Q15843 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NEDD8Q15843 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NEDD8Q15843 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NEDD8Q15843 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NEDD8Q15843 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
NEDD8Q15843 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
NEDD8Q15843 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
NEDD8Q15843 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
NEDD8Q15843 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
NEDD8Q15843 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
NEDD8Q15843 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
NEDD8Q15843 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
NEDD8Q15843 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NEDD8Q15843 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NEDD8Q15843 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NEDD8Q15843 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NEDD8Q15843 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NEDD8Q15843 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NEDD8Q15843 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NEDD8Q15843 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NEDD8Q15843 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NEDD8Q15843 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NEDD8Q15843 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NEDD8Q15843 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NEDD8Q15843 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NEDD8Q15843 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NEDD8Q15843 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NEDD8Q15843 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NEDD8Q15843 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NEDD8Q15843 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NEDD8Q15843 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NEDD8Q15843 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NEDD8Q15843 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NEDD8Q15843 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
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