Protein–RNA interactions for Protein: Q15517

CDSN, Corneodesmosin, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDSNQ15517 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CDSNQ15517 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CDSNQ15517 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CDSNQ15517 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
CDSNQ15517 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CDSNQ15517 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CDSNQ15517 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CDSNQ15517 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CDSNQ15517 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CDSNQ15517 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CDSNQ15517 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
CDSNQ15517 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CDSNQ15517 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CDSNQ15517 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CDSNQ15517 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CDSNQ15517 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CDSNQ15517 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CDSNQ15517 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CDSNQ15517 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CDSNQ15517 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CDSNQ15517 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
CDSNQ15517 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CDSNQ15517 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CDSNQ15517 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
CDSNQ15517 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CDSNQ15517 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CDSNQ15517 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CDSNQ15517 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
CDSNQ15517 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CDSNQ15517 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CDSNQ15517 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
CDSNQ15517 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CDSNQ15517 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CDSNQ15517 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CDSNQ15517 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
CDSNQ15517 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CDSNQ15517 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CDSNQ15517 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CDSNQ15517 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CDSNQ15517 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CDSNQ15517 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CDSNQ15517 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CDSNQ15517 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CDSNQ15517 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CDSNQ15517 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CDSNQ15517 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CDSNQ15517 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CDSNQ15517 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CDSNQ15517 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CDSNQ15517 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CDSNQ15517 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CDSNQ15517 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CDSNQ15517 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CDSNQ15517 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
CDSNQ15517 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CDSNQ15517 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CDSNQ15517 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
CDSNQ15517 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
CDSNQ15517 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
CDSNQ15517 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CDSNQ15517 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CDSNQ15517 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CDSNQ15517 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CDSNQ15517 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CDSNQ15517 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CDSNQ15517 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CDSNQ15517 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CDSNQ15517 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CDSNQ15517 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CDSNQ15517 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CDSNQ15517 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CDSNQ15517 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CDSNQ15517 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CDSNQ15517 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CDSNQ15517 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CDSNQ15517 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CDSNQ15517 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CDSNQ15517 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CDSNQ15517 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CDSNQ15517 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CDSNQ15517 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CDSNQ15517 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CDSNQ15517 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CDSNQ15517 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CDSNQ15517 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
CDSNQ15517 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CDSNQ15517 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CDSNQ15517 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CDSNQ15517 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CDSNQ15517 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CDSNQ15517 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
CDSNQ15517 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
CDSNQ15517 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
CDSNQ15517 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
CDSNQ15517 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
CDSNQ15517 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CDSNQ15517 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
CDSNQ15517 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CDSNQ15517 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CDSNQ15517 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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