Protein–RNA interactions for Protein: Q13564

NAE1, NEDD8-activating enzyme E1 regulatory subunit, humanhuman

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Length 534 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAE1Q13564 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NAE1Q13564 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NAE1Q13564 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
NAE1Q13564 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NAE1Q13564 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NAE1Q13564 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NAE1Q13564 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NAE1Q13564 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
NAE1Q13564 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NAE1Q13564 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NAE1Q13564 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NAE1Q13564 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NAE1Q13564 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NAE1Q13564 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NAE1Q13564 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NAE1Q13564 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
NAE1Q13564 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NAE1Q13564 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NAE1Q13564 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NAE1Q13564 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NAE1Q13564 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NAE1Q13564 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NAE1Q13564 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NAE1Q13564 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NAE1Q13564 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NAE1Q13564 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NAE1Q13564 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NAE1Q13564 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
NAE1Q13564 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NAE1Q13564 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NAE1Q13564 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NAE1Q13564 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NAE1Q13564 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NAE1Q13564 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NAE1Q13564 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
NAE1Q13564 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NAE1Q13564 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NAE1Q13564 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NAE1Q13564 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NAE1Q13564 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NAE1Q13564 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NAE1Q13564 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
NAE1Q13564 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NAE1Q13564 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NAE1Q13564 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NAE1Q13564 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NAE1Q13564 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NAE1Q13564 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NAE1Q13564 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NAE1Q13564 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NAE1Q13564 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NAE1Q13564 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NAE1Q13564 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NAE1Q13564 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NAE1Q13564 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NAE1Q13564 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NAE1Q13564 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NAE1Q13564 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NAE1Q13564 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NAE1Q13564 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NAE1Q13564 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NAE1Q13564 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NAE1Q13564 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NAE1Q13564 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NAE1Q13564 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NAE1Q13564 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NAE1Q13564 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NAE1Q13564 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NAE1Q13564 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NAE1Q13564 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NAE1Q13564 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NAE1Q13564 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
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NAE1Q13564 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NAE1Q13564 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NAE1Q13564 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NAE1Q13564 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NAE1Q13564 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NAE1Q13564 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NAE1Q13564 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
NAE1Q13564 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NAE1Q13564 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NAE1Q13564 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NAE1Q13564 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NAE1Q13564 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
NAE1Q13564 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NAE1Q13564 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NAE1Q13564 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NAE1Q13564 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NAE1Q13564 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NAE1Q13564 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NAE1Q13564 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NAE1Q13564 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NAE1Q13564 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NAE1Q13564 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NAE1Q13564 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NAE1Q13564 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NAE1Q13564 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NAE1Q13564 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NAE1Q13564 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
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