Protein–RNA interactions for Protein: Q13547

HDAC1, Histone deacetylase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC1Q13547 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HDAC1Q13547 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HDAC1Q13547 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HDAC1Q13547 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HDAC1Q13547 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HDAC1Q13547 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HDAC1Q13547 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HDAC1Q13547 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HDAC1Q13547 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
HDAC1Q13547 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HDAC1Q13547 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HDAC1Q13547 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HDAC1Q13547 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
HDAC1Q13547 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HDAC1Q13547 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HDAC1Q13547 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
HDAC1Q13547 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HDAC1Q13547 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HDAC1Q13547 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HDAC1Q13547 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HDAC1Q13547 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HDAC1Q13547 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HDAC1Q13547 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HDAC1Q13547 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HDAC1Q13547 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HDAC1Q13547 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HDAC1Q13547 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HDAC1Q13547 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
HDAC1Q13547 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HDAC1Q13547 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HDAC1Q13547 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HDAC1Q13547 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HDAC1Q13547 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HDAC1Q13547 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HDAC1Q13547 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
HDAC1Q13547 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HDAC1Q13547 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HDAC1Q13547 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
HDAC1Q13547 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HDAC1Q13547 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
HDAC1Q13547 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HDAC1Q13547 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HDAC1Q13547 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HDAC1Q13547 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HDAC1Q13547 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HDAC1Q13547 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HDAC1Q13547 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HDAC1Q13547 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HDAC1Q13547 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HDAC1Q13547 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HDAC1Q13547 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HDAC1Q13547 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
HDAC1Q13547 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HDAC1Q13547 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HDAC1Q13547 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HDAC1Q13547 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HDAC1Q13547 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HDAC1Q13547 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HDAC1Q13547 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HDAC1Q13547 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HDAC1Q13547 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HDAC1Q13547 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HDAC1Q13547 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HDAC1Q13547 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HDAC1Q13547 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HDAC1Q13547 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HDAC1Q13547 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HDAC1Q13547 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HDAC1Q13547 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HDAC1Q13547 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HDAC1Q13547 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HDAC1Q13547 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HDAC1Q13547 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HDAC1Q13547 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
HDAC1Q13547 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HDAC1Q13547 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HDAC1Q13547 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HDAC1Q13547 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
HDAC1Q13547 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HDAC1Q13547 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
HDAC1Q13547 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HDAC1Q13547 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HDAC1Q13547 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HDAC1Q13547 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HDAC1Q13547 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
HDAC1Q13547 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HDAC1Q13547 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HDAC1Q13547 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HDAC1Q13547 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HDAC1Q13547 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HDAC1Q13547 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HDAC1Q13547 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HDAC1Q13547 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HDAC1Q13547 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HDAC1Q13547 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HDAC1Q13547 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HDAC1Q13547 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HDAC1Q13547 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HDAC1Q13547 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HDAC1Q13547 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
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