Protein–RNA interactions for Protein: Q13449

LSAMP, Limbic system-associated membrane protein, humanhuman

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSAMPQ13449 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LSAMPQ13449 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LSAMPQ13449 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LSAMPQ13449 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LSAMPQ13449 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LSAMPQ13449 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LSAMPQ13449 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LSAMPQ13449 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LSAMPQ13449 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LSAMPQ13449 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LSAMPQ13449 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LSAMPQ13449 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LSAMPQ13449 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LSAMPQ13449 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LSAMPQ13449 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LSAMPQ13449 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LSAMPQ13449 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LSAMPQ13449 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LSAMPQ13449 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LSAMPQ13449 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LSAMPQ13449 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LSAMPQ13449 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LSAMPQ13449 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LSAMPQ13449 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LSAMPQ13449 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LSAMPQ13449 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LSAMPQ13449 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LSAMPQ13449 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LSAMPQ13449 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LSAMPQ13449 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LSAMPQ13449 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LSAMPQ13449 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LSAMPQ13449 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LSAMPQ13449 TAF6-205ENST00000437822 2318 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LSAMPQ13449 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LSAMPQ13449 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LSAMPQ13449 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LSAMPQ13449 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LSAMPQ13449 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LSAMPQ13449 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LSAMPQ13449 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LSAMPQ13449 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LSAMPQ13449 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
LSAMPQ13449 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LSAMPQ13449 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LSAMPQ13449 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LSAMPQ13449 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LSAMPQ13449 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LSAMPQ13449 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LSAMPQ13449 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LSAMPQ13449 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
LSAMPQ13449 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LSAMPQ13449 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LSAMPQ13449 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LSAMPQ13449 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LSAMPQ13449 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
LSAMPQ13449 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LSAMPQ13449 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LSAMPQ13449 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LSAMPQ13449 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LSAMPQ13449 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LSAMPQ13449 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LSAMPQ13449 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LSAMPQ13449 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LSAMPQ13449 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LSAMPQ13449 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LSAMPQ13449 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LSAMPQ13449 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LSAMPQ13449 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LSAMPQ13449 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LSAMPQ13449 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LSAMPQ13449 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LSAMPQ13449 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LSAMPQ13449 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LSAMPQ13449 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LSAMPQ13449 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LSAMPQ13449 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LSAMPQ13449 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LSAMPQ13449 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LSAMPQ13449 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LSAMPQ13449 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LSAMPQ13449 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LSAMPQ13449 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LSAMPQ13449 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LSAMPQ13449 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LSAMPQ13449 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LSAMPQ13449 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LSAMPQ13449 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LSAMPQ13449 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LSAMPQ13449 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LSAMPQ13449 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LSAMPQ13449 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LSAMPQ13449 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LSAMPQ13449 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
LSAMPQ13449 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
LSAMPQ13449 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LSAMPQ13449 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LSAMPQ13449 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
LSAMPQ13449 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LSAMPQ13449 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 149.7 ms