Protein–RNA interactions for Protein: Q13291

SLAMF1, Signaling lymphocytic activation molecule, humanhuman

Predictions only

Length 335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLAMF1Q13291 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLAMF1Q13291 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLAMF1Q13291 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLAMF1Q13291 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLAMF1Q13291 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLAMF1Q13291 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLAMF1Q13291 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLAMF1Q13291 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLAMF1Q13291 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLAMF1Q13291 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLAMF1Q13291 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLAMF1Q13291 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLAMF1Q13291 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLAMF1Q13291 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLAMF1Q13291 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLAMF1Q13291 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLAMF1Q13291 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLAMF1Q13291 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLAMF1Q13291 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLAMF1Q13291 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLAMF1Q13291 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLAMF1Q13291 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLAMF1Q13291 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SLAMF1Q13291 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SLAMF1Q13291 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SLAMF1Q13291 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SLAMF1Q13291 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SLAMF1Q13291 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SLAMF1Q13291 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SLAMF1Q13291 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SLAMF1Q13291 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SLAMF1Q13291 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SLAMF1Q13291 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SLAMF1Q13291 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SLAMF1Q13291 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SLAMF1Q13291 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLAMF1Q13291 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLAMF1Q13291 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLAMF1Q13291 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLAMF1Q13291 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLAMF1Q13291 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLAMF1Q13291 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLAMF1Q13291 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLAMF1Q13291 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLAMF1Q13291 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLAMF1Q13291 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLAMF1Q13291 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLAMF1Q13291 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLAMF1Q13291 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLAMF1Q13291 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLAMF1Q13291 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLAMF1Q13291 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLAMF1Q13291 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLAMF1Q13291 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLAMF1Q13291 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLAMF1Q13291 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLAMF1Q13291 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLAMF1Q13291 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLAMF1Q13291 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SLAMF1Q13291 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLAMF1Q13291 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLAMF1Q13291 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLAMF1Q13291 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLAMF1Q13291 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLAMF1Q13291 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLAMF1Q13291 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SLAMF1Q13291 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLAMF1Q13291 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLAMF1Q13291 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLAMF1Q13291 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLAMF1Q13291 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLAMF1Q13291 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLAMF1Q13291 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLAMF1Q13291 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLAMF1Q13291 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLAMF1Q13291 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLAMF1Q13291 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLAMF1Q13291 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLAMF1Q13291 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLAMF1Q13291 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLAMF1Q13291 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLAMF1Q13291 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLAMF1Q13291 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLAMF1Q13291 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLAMF1Q13291 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLAMF1Q13291 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLAMF1Q13291 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLAMF1Q13291 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLAMF1Q13291 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLAMF1Q13291 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLAMF1Q13291 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLAMF1Q13291 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLAMF1Q13291 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLAMF1Q13291 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLAMF1Q13291 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLAMF1Q13291 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLAMF1Q13291 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SLAMF1Q13291 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLAMF1Q13291 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLAMF1Q13291 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms